More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2941 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  80.03 
 
 		 589 aa  949    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  60.51 
 
 		 624 aa  725    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  80.2 
 
 		 648 aa  952    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  100 
 
 		 589 aa  1206    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  93.68 
 
 		 633 aa  1133    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  58.87 
 
 		 630 aa  685    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  61.31 
 
 		 671 aa  730    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  59.72 
 
 		 618 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  61.43 
 
 		 640 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  58.67 
 
 		 632 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  56.88 
 
 		 626 aa  676    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  67.74 
 
 		 626 aa  822    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  53.52 
 
 		 619 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  59.08 
 
 		 633 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  59.08 
 
 		 628 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  56.53 
 
 		 617 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  58.36 
 
 		 635 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  59.08 
 
 		 633 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  59.72 
 
 		 618 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  80.38 
 
 		 627 aa  957    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  60.24 
 
 		 633 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  51.35 
 
 		 619 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  51.8 
 
 		 618 aa  611  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  49.74 
 
 		 630 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  49.23 
 
 		 635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  47.95 
 
 		 631 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  47.44 
 
 		 617 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  46.82 
 
 		 609 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  45.42 
 
 		 606 aa  528  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  43.87 
 
 		 643 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  44.62 
 
 		 611 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  43.87 
 
 		 625 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  41.92 
 
 		 618 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  44.03 
 
 		 617 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  41.89 
 
 		 624 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  40.48 
 
 		 599 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 		 631 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  39.83 
 
 		 627 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  38.79 
 
 		 618 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  41.88 
 
 		 622 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  41.14 
 
 		 624 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  41.67 
 
 		 624 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  39.17 
 
 		 631 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  39.51 
 
 		 619 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  42.39 
 
 		 605 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  39.93 
 
 		 629 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  39.44 
 
 		 626 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  36.26 
 
 		 573 aa  359  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  64.04 
 
 		 279 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  36.92 
 
 		 620 aa  345  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  37.54 
 
 		 603 aa  343  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 560 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  25.2 
 
 		 630 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 		 633 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  22.9 
 
 		 587 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  22.46 
 
 		 590 aa  124  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0835  feruloyl-CoA synthetase  50 
 
 		 312 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 		 606 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 		 606 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22.26 
 
 		 610 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  23.57 
 
 		 592 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  22.22 
 
 		 604 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  25.33 
 
 		 606 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 		 598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  22.31 
 
 		 610 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  23.25 
 
 		 607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  23.08 
 
 		 592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  23 
 
 		 598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  23.15 
 
 		 598 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  23.24 
 
 		 592 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  24.83 
 
 		 622 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  22.44 
 
 		 596 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  22.65 
 
 		 610 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  22.38 
 
 		 679 aa  108  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  23.33 
 
 		 633 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  24.88 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2423  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 1549 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  22.93 
 
 		 597 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  22.94 
 
 		 702 aa  104  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  22.77 
 
 		 597 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  25.41 
 
 		 1549 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2510  AMP-dependent synthetase and ligase  25.98 
 
 		 1549 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  21.37 
 
 		 607 aa  103  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  22.77 
 
 		 597 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.15 
 
 		 562 aa  103  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1437  AMP-dependent synthetase and ligase  25.98 
 
 		 1460 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  23.14 
 
 		 598 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  21.98 
 
 		 597 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.7 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  25.12 
 
 		 610 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  24.83 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 		 600 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  23.11 
 
 		 649 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.76 
 
 		 601 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.28 
 
 		 563 aa  100  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  22.47 
 
 		 568 aa  99.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  22.6 
 
 		 598 aa  99.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  22.71 
 
 		 597 aa  100  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  23.11 
 
 		 555 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  24.48 
 
 		 661 aa  99  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>