More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2493 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  56.86 
 
 		 617 aa  670    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 625 aa  1271    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  46.36 
 
 		 617 aa  554  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  47.01 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  46.62 
 
 		 635 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  46.08 
 
 		 619 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  45.71 
 
 		 630 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  47.19 
 
 		 609 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  47.99 
 
 		 626 aa  532  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  46.48 
 
 		 599 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  45.78 
 
 		 606 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  47.29 
 
 		 605 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  47.46 
 
 		 627 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  48.58 
 
 		 589 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  48.23 
 
 		 648 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  45.35 
 
 		 617 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  45.65 
 
 		 618 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  45.12 
 
 		 633 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  45.3 
 
 		 626 aa  495  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  45.26 
 
 		 619 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  45.52 
 
 		 618 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  44.25 
 
 		 589 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  46.42 
 
 		 671 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  44.99 
 
 		 619 aa  485  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  44.92 
 
 		 624 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  45.99 
 
 		 640 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  45.25 
 
 		 624 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  46.7 
 
 		 611 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  46.89 
 
 		 622 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  44.89 
 
 		 633 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  46.27 
 
 		 631 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  42.1 
 
 		 643 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  44.59 
 
 		 624 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  43.98 
 
 		 630 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  42.74 
 
 		 618 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  43.98 
 
 		 635 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  44.26 
 
 		 624 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  43.85 
 
 		 628 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  44.19 
 
 		 633 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  44.19 
 
 		 633 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  43.81 
 
 		 632 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  43.98 
 
 		 618 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  43.98 
 
 		 618 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  42.06 
 
 		 629 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  40.36 
 
 		 620 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  40.36 
 
 		 627 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  40.53 
 
 		 626 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  39.41 
 
 		 573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  38.36 
 
 		 631 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  35.46 
 
 		 603 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  43.73 
 
 		 279 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 560 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  22.78 
 
 		 607 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 		 612 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 		 604 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  24.71 
 
 		 616 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  20.7 
 
 		 610 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22.48 
 
 		 610 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  22.86 
 
 		 587 aa  117  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  24.42 
 
 		 633 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  22.73 
 
 		 590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  24.37 
 
 		 592 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  21.25 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  23.9 
 
 		 663 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  24.32 
 
 		 607 aa  110  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  21.38 
 
 		 610 aa  110  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  20.6 
 
 		 610 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  20.45 
 
 		 610 aa  107  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  33.06 
 
 		 506 aa  103  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  22.05 
 
 		 603 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  25.38 
 
 		 551 aa  102  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  24.29 
 
 		 598 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  25.33 
 
 		 551 aa  101  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1468  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.41 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  27.11 
 
 		 510 aa  101  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  26.17 
 
 		 1549 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 660 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 		 508 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  24.01 
 
 		 555 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  22 
 
 		 592 aa  100  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  24.45 
 
 		 551 aa  100  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  32.26 
 
 		 501 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  23.69 
 
 		 601 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  28.86 
 
 		 507 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 		 508 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 		 568 aa  98.6  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.240811  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  23.89 
 
 		 605 aa  98.6  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 498 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  22.93 
 
 		 609 aa  98.6  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  26.87 
 
 		 510 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 511 aa  97.8  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 		 567 aa  97.4  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  24.73 
 
 		 551 aa  97.1  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  26.11 
 
 		 503 aa  96.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  25.18 
 
 		 606 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  23.19 
 
 		 601 aa  95.9  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 		 554 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  24.51 
 
 		 555 aa  95.1  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.11 
 
 		 566 aa  95.5  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>