More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4868 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  62.39 
 
 		 589 aa  725    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  65.67 
 
 		 624 aa  794    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  58.57 
 
 		 648 aa  739    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  61.31 
 
 		 589 aa  730    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  60.47 
 
 		 626 aa  719    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  60.26 
 
 		 633 aa  744    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 671 aa  1367    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  56.73 
 
 		 617 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  65.61 
 
 		 618 aa  747    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  60.83 
 
 		 626 aa  733    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  65.51 
 
 		 632 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  65.61 
 
 		 618 aa  747    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  61.58 
 
 		 627 aa  755    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  68.2 
 
 		 640 aa  828    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  67.41 
 
 		 633 aa  774    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  66.11 
 
 		 630 aa  786    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  69.82 
 
 		 633 aa  868    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  65.95 
 
 		 635 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  67.41 
 
 		 633 aa  774    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  66.78 
 
 		 628 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  52.99 
 
 		 619 aa  632  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  53.03 
 
 		 618 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  54.82 
 
 		 619 aa  627  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  51.1 
 
 		 630 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  50.59 
 
 		 635 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  50.5 
 
 		 631 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  47.76 
 
 		 609 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  47.46 
 
 		 606 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  44.76 
 
 		 617 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  46.27 
 
 		 643 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  46.42 
 
 		 625 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  44.37 
 
 		 618 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  46.35 
 
 		 617 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  44.2 
 
 		 618 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  42.74 
 
 		 624 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  45.71 
 
 		 611 aa  439  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  39.9 
 
 		 619 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  42.62 
 
 		 624 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  43.26 
 
 		 631 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  41.4 
 
 		 599 aa  419  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  42.38 
 
 		 624 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  42.09 
 
 		 622 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  42.31 
 
 		 605 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  40.45 
 
 		 620 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  39.42 
 
 		 627 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  39.05 
 
 		 629 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  38.5 
 
 		 631 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  37.94 
 
 		 573 aa  359  8e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  38.05 
 
 		 603 aa  357  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  66.04 
 
 		 279 aa  356  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  35.73 
 
 		 626 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 560 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0835  feruloyl-CoA synthetase  59.16 
 
 		 312 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  24.39 
 
 		 587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  25.55 
 
 		 630 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  25.16 
 
 		 633 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  24.56 
 
 		 607 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  24.02 
 
 		 610 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  25.12 
 
 		 609 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  23.84 
 
 		 592 aa  114  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 600 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  26.21 
 
 		 622 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 		 633 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  25.12 
 
 		 609 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  25.94 
 
 		 607 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22.82 
 
 		 610 aa  108  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 567 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  21.85 
 
 		 592 aa  107  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 649 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  25.33 
 
 		 610 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  23.88 
 
 		 612 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  24.32 
 
 		 598 aa  102  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  22.06 
 
 		 590 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  24.75 
 
 		 606 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  24.59 
 
 		 606 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  24.88 
 
 		 606 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  23.24 
 
 		 609 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  24.22 
 
 		 596 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  20.95 
 
 		 610 aa  98.2  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  25.93 
 
 		 604 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  23.37 
 
 		 613 aa  97.8  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  28.61 
 
 		 825 aa  97.4  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  23.85 
 
 		 605 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  25.77 
 
 		 604 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22.84 
 
 		 610 aa  96.7  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 		 604 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  21.73 
 
 		 610 aa  95.5  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  21.87 
 
 		 555 aa  95.5  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  23.62 
 
 		 599 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  24.92 
 
 		 616 aa  95.5  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 620 aa  95.5  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  25.12 
 
 		 622 aa  94.7  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  24.64 
 
 		 647 aa  94.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  23.98 
 
 		 602 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  23.09 
 
 		 604 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  22.41 
 
 		 592 aa  94.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  26.4 
 
 		 663 aa  94  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  24.34 
 
 		 576 aa  94  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  21.82 
 
 		 555 aa  93.2  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  23 
 
 		 603 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>