More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6949 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 617 aa  1248    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  57.02 
 
 		 625 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  48.64 
 
 		 619 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  45.94 
 
 		 599 aa  531  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  45.63 
 
 		 609 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  46.37 
 
 		 635 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  49.18 
 
 		 605 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  49.34 
 
 		 631 aa  524  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  46.21 
 
 		 606 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  45.87 
 
 		 630 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  42.64 
 
 		 617 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  45.39 
 
 		 631 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  45.24 
 
 		 618 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  45.7 
 
 		 626 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  46.49 
 
 		 635 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  45.38 
 
 		 618 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  46.49 
 
 		 630 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  47.99 
 
 		 628 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  47.65 
 
 		 633 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  47.65 
 
 		 633 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  44.24 
 
 		 624 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  45.3 
 
 		 619 aa  482  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  46.3 
 
 		 648 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  46.3 
 
 		 627 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  44.67 
 
 		 624 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  46.94 
 
 		 589 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  44.3 
 
 		 633 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  46.14 
 
 		 622 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  43.6 
 
 		 618 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  47.08 
 
 		 640 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  44.59 
 
 		 626 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  45.13 
 
 		 624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  46.35 
 
 		 671 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  46.82 
 
 		 632 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  45.84 
 
 		 617 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  44.26 
 
 		 624 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  43.7 
 
 		 619 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  46.36 
 
 		 633 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  42.32 
 
 		 643 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  44.03 
 
 		 589 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  44.93 
 
 		 611 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  44.46 
 
 		 618 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  44.46 
 
 		 618 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  42.06 
 
 		 629 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  42.78 
 
 		 620 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  42.83 
 
 		 573 aa  429  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  42.28 
 
 		 631 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  40.17 
 
 		 627 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  38.17 
 
 		 603 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  38.41 
 
 		 626 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  45.65 
 
 		 279 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 560 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  23.79 
 
 		 587 aa  124  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.53 
 
 		 590 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0200  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  24.08 
 
 		 551 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  22.92 
 
 		 592 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  24.84 
 
 		 633 aa  114  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.01 
 
 		 560 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  28.21 
 
 		 564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 		 569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 617 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  23.68 
 
 		 555 aa  111  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  24.52 
 
 		 551 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  24.06 
 
 		 551 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  23.32 
 
 		 602 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  26.23 
 
 		 610 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2780  AMP-binding domain-containing protein  27.66 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1154  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  27.66 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.97 
 
 		 560 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  24.25 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.11 
 
 		 557 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.73 
 
 		 566 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2935  AMP-binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 553 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  23.28 
 
 		 610 aa  107  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.72 
 
 		 566 aa  107  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  25.2 
 
 		 598 aa  107  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  23.83 
 
 		 612 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  24.25 
 
 		 554 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 598 aa  107  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.76 
 
 		 500 aa  106  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  26.95 
 
 		 630 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.28 
 
 		 602 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  24.25 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  22.72 
 
 		 551 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  30.82 
 
 		 501 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.240811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 		 616 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.68 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 579 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.97 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  30.92 
 
 		 501 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  33.46 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2581  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.68 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  23.32 
 
 		 554 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.38 
 
 		 563 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  23.32 
 
 		 554 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.68 
 
 		 557 aa  104  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 		 584 aa  104  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>