More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14250 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  69.43 
 
 		 589 aa  818    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  62.44 
 
 		 624 aa  746    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  67.74 
 
 		 589 aa  822    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  57.47 
 
 		 626 aa  705    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 626 aa  1255    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  65.84 
 
 		 633 aa  824    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  60.83 
 
 		 671 aa  733    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  60.99 
 
 		 618 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  60.99 
 
 		 618 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  67.26 
 
 		 627 aa  833    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  58.18 
 
 		 632 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  62.1 
 
 		 640 aa  729    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  54.8 
 
 		 617 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  51.98 
 
 		 619 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  58.6 
 
 		 628 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  59.01 
 
 		 630 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  59.45 
 
 		 633 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  67.8 
 
 		 648 aa  840    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  58.35 
 
 		 635 aa  688    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  59.45 
 
 		 633 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  61.87 
 
 		 633 aa  749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  51.82 
 
 		 618 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  51.89 
 
 		 619 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  49 
 
 		 630 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  49.5 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  49.58 
 
 		 606 aa  578  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  48.49 
 
 		 631 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  47.66 
 
 		 609 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  47.15 
 
 		 617 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  45.75 
 
 		 643 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  45.3 
 
 		 625 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  43.34 
 
 		 599 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  44.59 
 
 		 617 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  42.13 
 
 		 618 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  44.44 
 
 		 611 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  43.09 
 
 		 605 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  43.12 
 
 		 624 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  42.88 
 
 		 624 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  42.67 
 
 		 622 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  43.42 
 
 		 624 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  40.51 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  38.41 
 
 		 618 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  41.9 
 
 		 619 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  43.52 
 
 		 631 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  39.84 
 
 		 627 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  37.12 
 
 		 631 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  37.54 
 
 		 620 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  38.95 
 
 		 573 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  40.84 
 
 		 626 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  66.67 
 
 		 279 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  36.99 
 
 		 603 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 560 aa  208  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  27.11 
 
 		 630 aa  140  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.16 
 
 		 590 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  24.43 
 
 		 679 aa  131  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  22.62 
 
 		 587 aa  128  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  24.33 
 
 		 592 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  24.55 
 
 		 633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  25.46 
 
 		 606 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0835  feruloyl-CoA synthetase  47.74 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  24.22 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  25.04 
 
 		 701 aa  118  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  25.5 
 
 		 606 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  25.77 
 
 		 620 aa  117  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  26.12 
 
 		 607 aa  117  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  25.5 
 
 		 606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  23.16 
 
 		 702 aa  114  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  25.62 
 
 		 567 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 		 601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 		 604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 633 aa  111  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  23.56 
 
 		 609 aa  111  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  22.77 
 
 		 555 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  24.57 
 
 		 612 aa  110  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  24.25 
 
 		 559 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  24.2 
 
 		 606 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  21.77 
 
 		 607 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  22.91 
 
 		 603 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22.8 
 
 		 610 aa  108  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 647 aa  107  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  23.72 
 
 		 609 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  22.38 
 
 		 596 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  23.44 
 
 		 607 aa  106  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  24.31 
 
 		 663 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 		 1549 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 602 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  24.06 
 
 		 592 aa  103  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  24.07 
 
 		 605 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  22.92 
 
 		 598 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  23.42 
 
 		 598 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  24.05 
 
 		 617 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 613 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  24.55 
 
 		 622 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  24.61 
 
 		 560 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.96 
 
 		 562 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  24.01 
 
 		 605 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  21.38 
 
 		 610 aa  101  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 903 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  25.24 
 
 		 604 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  24.76 
 
 		 604 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>