More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0753 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  52.03 
 
 		 624 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 618 aa  1260    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  50.89 
 
 		 624 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 624 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  50.24 
 
 		 622 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  48.94 
 
 		 618 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  44.61 
 
 		 606 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  46.68 
 
 		 620 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  44.93 
 
 		 617 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  44.31 
 
 		 626 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  43.96 
 
 		 630 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  45.16 
 
 		 625 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  45.5 
 
 		 640 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  42.46 
 
 		 609 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  42.27 
 
 		 619 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  43 
 
 		 635 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  42.37 
 
 		 631 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  44.01 
 
 		 630 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  45.69 
 
 		 617 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  44.37 
 
 		 671 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  43.73 
 
 		 635 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  42.41 
 
 		 627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  44.33 
 
 		 628 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  41.75 
 
 		 603 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  43.23 
 
 		 631 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  42.13 
 
 		 626 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  42.06 
 
 		 648 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  42.01 
 
 		 619 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  44.33 
 
 		 633 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  44.33 
 
 		 633 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  41.67 
 
 		 633 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  43.62 
 
 		 633 aa  465  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  43.1 
 
 		 589 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  42 
 
 		 629 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  40.99 
 
 		 618 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  41.92 
 
 		 589 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  41.41 
 
 		 631 aa  458  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  41.47 
 
 		 624 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  37.95 
 
 		 617 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  40.64 
 
 		 619 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  42.9 
 
 		 632 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  40.6 
 
 		 643 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  40.03 
 
 		 627 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  40.19 
 
 		 626 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  41.87 
 
 		 611 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  41.51 
 
 		 618 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  41.51 
 
 		 618 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  38.94 
 
 		 599 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  41.71 
 
 		 605 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  38.24 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  42.49 
 
 		 279 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 560 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 		 592 aa  140  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  25.5 
 
 		 630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  24.29 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  22.87 
 
 		 590 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  23.73 
 
 		 547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  24.45 
 
 		 602 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 		 606 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  23.41 
 
 		 602 aa  114  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  24.96 
 
 		 633 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  24.26 
 
 		 598 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.66 
 
 		 601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  24.89 
 
 		 555 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.59 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  24.45 
 
 		 555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  24.4 
 
 		 609 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  26.37 
 
 		 606 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  24.01 
 
 		 598 aa  110  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  24.71 
 
 		 604 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  22.89 
 
 		 598 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  24.4 
 
 		 609 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1256  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 		 572 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.775315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  26.53 
 
 		 606 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  25.08 
 
 		 612 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  24.12 
 
 		 633 aa  109  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  24.42 
 
 		 602 aa  107  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  21.8 
 
 		 601 aa  107  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  21.89 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  21.89 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  22.5 
 
 		 601 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  23.78 
 
 		 597 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 		 660 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  23.51 
 
 		 601 aa  104  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  21.72 
 
 		 588 aa  104  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  25.2 
 
 		 607 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  23.83 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  29.12 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.01 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 507 aa  102  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  24.57 
 
 		 620 aa  102  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  21.97 
 
 		 597 aa  102  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  22.37 
 
 		 592 aa  101  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  21.97 
 
 		 597 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.38 
 
 		 598 aa  101  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  21.81 
 
 		 597 aa  101  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.78 
 
 		 516 aa  99.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  30.61 
 
 		 4575 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  23.87 
 
 		 604 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>