More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0667 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 573 aa  1150    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  40.26 
 
 		 619 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  41.16 
 
 		 609 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  42.83 
 
 		 617 aa  429  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  40.07 
 
 		 617 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  39.1 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  41.78 
 
 		 635 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  40.67 
 
 		 631 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  41.15 
 
 		 630 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  39.35 
 
 		 625 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  38.01 
 
 		 643 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  39.69 
 
 		 618 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  39.77 
 
 		 626 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  37.6 
 
 		 619 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  38.85 
 
 		 619 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  39.79 
 
 		 606 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 		 631 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  39.9 
 
 		 605 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  38.07 
 
 		 617 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  38.68 
 
 		 633 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  38.68 
 
 		 633 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  38.07 
 
 		 630 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  37.93 
 
 		 627 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  38.01 
 
 		 635 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  38.58 
 
 		 628 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  38.24 
 
 		 618 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  38.95 
 
 		 626 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  37.98 
 
 		 632 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  37.48 
 
 		 589 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  37.69 
 
 		 648 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  37.84 
 
 		 624 aa  364  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  36.74 
 
 		 633 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  38.23 
 
 		 633 aa  360  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  37.94 
 
 		 671 aa  359  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  36.26 
 
 		 589 aa  359  9e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  36.5 
 
 		 624 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  38.51 
 
 		 640 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  37.2 
 
 		 629 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  38.42 
 
 		 618 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  38.42 
 
 		 618 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  36.52 
 
 		 624 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  36.75 
 
 		 624 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  39.44 
 
 		 611 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  37.18 
 
 		 622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  36.49 
 
 		 618 aa  327  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  36.5 
 
 		 620 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  35.56 
 
 		 626 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  36.33 
 
 		 603 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  34.74 
 
 		 627 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  32.51 
 
 		 631 aa  299  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 560 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  37.83 
 
 		 279 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  24.59 
 
 		 590 aa  117  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 592 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  29.08 
 
 		 530 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  23.5 
 
 		 607 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 		 604 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 		 567 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 560 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  24.72 
 
 		 633 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  25.41 
 
 		 600 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 558 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 903 aa  98.6  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  25.93 
 
 		 597 aa  97.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  27.37 
 
 		 547 aa  97.1  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  25.52 
 
 		 702 aa  97.1  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  24.83 
 
 		 597 aa  97.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  29.63 
 
 		 511 aa  97.1  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.36 
 
 		 562 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 526 aa  96.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.108294  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.21 
 
 		 606 aa  96.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 608 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 500 aa  95.1  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 604 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 		 612 aa  95.1  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  23.17 
 
 		 609 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.13 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.24 
 
 		 562 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  31.61 
 
 		 544 aa  94.7  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.11 
 
 		 562 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.21 
 
 		 506 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 553 aa  94.4  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.21 
 
 		 506 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.21 
 
 		 506 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  24.63 
 
 		 596 aa  94  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  24.67 
 
 		 551 aa  93.6  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.55 
 
 		 566 aa  93.6  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.06 
 
 		 566 aa  93.6  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 825 aa  93.6  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  29.49 
 
 		 503 aa  93.6  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.03 
 
 		 515 aa  93.2  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.58 
 
 		 572 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  29.87 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.57 
 
 		 573 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.58 
 
 		 572 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1495  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.34 
 
 		 562 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6065  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 		 559 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.95 
 
 		 563 aa  92  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  28.15 
 
 		 601 aa  91.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>