More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2397 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  100 
 
 		 501 aa  1021    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  52.64 
 
 		 503 aa  524  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3360  benzoate-CoA ligase family  51.6 
 
 		 505 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  45.35 
 
 		 513 aa  448  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  43.41 
 
 		 527 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  44.31 
 
 		 528 aa  382  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  42.27 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  43.25 
 
 		 531 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  41.88 
 
 		 532 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  41.94 
 
 		 549 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  42.25 
 
 		 553 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  39.49 
 
 		 523 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  42.61 
 
 		 550 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  41.54 
 
 		 524 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  41.91 
 
 		 530 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  42.01 
 
 		 530 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  39.73 
 
 		 537 aa  356  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  41.1 
 
 		 517 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  38.46 
 
 		 525 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  40.79 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  42.28 
 
 		 533 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  39.73 
 
 		 519 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  40.28 
 
 		 503 aa  350  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  41.35 
 
 		 524 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  41.42 
 
 		 518 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  41.26 
 
 		 527 aa  346  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  40.69 
 
 		 524 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  41.28 
 
 		 526 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  41.44 
 
 		 531 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  41.36 
 
 		 519 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  38.14 
 
 		 521 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  40.43 
 
 		 521 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  41.57 
 
 		 518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  37.75 
 
 		 520 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  40.94 
 
 		 532 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  39.77 
 
 		 515 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0736  benzoate-CoA ligase family  38.66 
 
 		 539 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  38.92 
 
 		 554 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  36.33 
 
 		 535 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  33.27 
 
 		 541 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1765  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 514 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459624  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 557 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 543 aa  259  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  33.89 
 
 		 567 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 542 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51430  coenzyme A ligase  34.96 
 
 		 517 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  34.23 
 
 		 547 aa  250  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 539 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 538 aa  246  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4402  coenzyme A ligase  35 
 
 		 517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  32.49 
 
 		 542 aa  243  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 551 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.61 
 
 		 510 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3763  benzoate-coenzyme A ligase  36.69 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0336097  normal  0.403317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.61 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 551 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 		 510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.95 
 
 		 510 aa  240  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.41 
 
 		 510 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.41 
 
 		 510 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.41 
 
 		 510 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.41 
 
 		 510 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 542 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  33.13 
 
 		 539 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  33.59 
 
 		 541 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.42 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 539 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12962  acyl-CoA synthetase  32.91 
 
 		 705 aa  233  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 500 aa  233  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 538 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 538 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 529 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 546 aa  230  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 545 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 539 aa  229  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.16 
 
 		 514 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 510 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 548 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.4 
 
 		 541 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 546 aa  224  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  32.94 
 
 		 522 aa  223  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.4 
 
 		 541 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  33.26 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.4 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4971  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 556 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 501 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 546 aa  220  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.3 
 
 		 510 aa  217  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 521 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.38 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 493 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>