More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1328 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
539 aa  1109    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  77.94 
 
 
538 aa  866    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  72.68 
 
 
546 aa  829    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  55.24 
 
 
567 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  55.43 
 
 
539 aa  595  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  54.6 
 
 
542 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  53.37 
 
 
546 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  53.35 
 
 
543 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  53.66 
 
 
546 aa  561  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  53.04 
 
 
553 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  52.14 
 
 
539 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  50.28 
 
 
548 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  51.58 
 
 
529 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  50.64 
 
 
545 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  51.21 
 
 
546 aa  532  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  51.21 
 
 
538 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  50.82 
 
 
546 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  51.21 
 
 
538 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  50.37 
 
 
546 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  49.64 
 
 
557 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  52.76 
 
 
539 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  47.94 
 
 
542 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  49.63 
 
 
542 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  47.94 
 
 
547 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  46.72 
 
 
541 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  46.72 
 
 
541 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  46.72 
 
 
541 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  46.72 
 
 
541 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  44.3 
 
 
551 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  44.42 
 
 
551 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 
546 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  34.64 
 
 
525 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  34.06 
 
 
523 aa  294  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  35.69 
 
 
528 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
549 aa  286  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  34.84 
 
 
519 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  34.53 
 
 
527 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  35.58 
 
 
533 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  35.49 
 
 
517 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  34.89 
 
 
528 aa  266  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  36.52 
 
 
519 aa  263  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  33.78 
 
 
554 aa  262  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  35.73 
 
 
549 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  34.77 
 
 
515 aa  260  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  36.12 
 
 
527 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 
506 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  35.2 
 
 
550 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  33.87 
 
 
503 aa  256  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  35.05 
 
 
524 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  34.19 
 
 
535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 
537 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  34.13 
 
 
513 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  33.65 
 
 
518 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
571 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  34.82 
 
 
553 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  33.6 
 
 
521 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  34.67 
 
 
524 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  35.27 
 
 
531 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 
537 aa  248  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  35.43 
 
 
532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  34.23 
 
 
524 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  32.08 
 
 
586 aa  244  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 
555 aa  243  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  35.05 
 
 
518 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  34.97 
 
 
526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 
552 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  36.23 
 
 
531 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  33.2 
 
 
532 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
492 aa  238  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
552 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 
627 aa  233  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  34.48 
 
 
530 aa  233  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  34.45 
 
 
530 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  33.33 
 
 
501 aa  230  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 
555 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
566 aa  228  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  30.63 
 
 
541 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 
559 aa  226  8e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 
559 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  30.43 
 
 
521 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
559 aa  224  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 
530 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  33.6 
 
 
528 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  32.04 
 
 
563 aa  223  9e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  33.4 
 
 
522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 
552 aa  221  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
548 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  31.62 
 
 
503 aa  221  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 
528 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 
552 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  32.28 
 
 
528 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 
554 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
528 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.2 
 
 
528 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 
528 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 
528 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
528 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.66 
 
 
549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 
530 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
522 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>