More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2116 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  66.04 
 
 		 539 aa  720    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  62.87 
 
 		 567 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  64.85 
 
 		 538 aa  711    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  61.5 
 
 		 548 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1111    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  59.09 
 
 		 546 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  56.54 
 
 		 545 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  60.37 
 
 		 553 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  64.85 
 
 		 538 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  65.67 
 
 		 543 aa  732    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  62.9 
 
 		 546 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  66.6 
 
 		 539 aa  683    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  57.12 
 
 		 542 aa  622  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  55.68 
 
 		 546 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  57.71 
 
 		 529 aa  620  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  54.76 
 
 		 546 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  55.27 
 
 		 557 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  56.33 
 
 		 546 aa  609  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  55.41 
 
 		 541 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  55.78 
 
 		 541 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  55.22 
 
 		 541 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  55.41 
 
 		 541 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  55.43 
 
 		 539 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  55.68 
 
 		 538 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  54.19 
 
 		 546 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  55.14 
 
 		 547 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  55.35 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  53.23 
 
 		 551 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  54.38 
 
 		 542 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  53.53 
 
 		 551 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  43.31 
 
 		 546 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  37.38 
 
 		 527 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 		 549 aa  320  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  36.33 
 
 		 525 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  34.63 
 
 		 528 aa  306  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  33.53 
 
 		 523 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 537 aa  293  8e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  33.2 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  36.04 
 
 		 531 aa  286  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  33.97 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  35.34 
 
 		 519 aa  283  8.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  33.94 
 
 		 586 aa  282  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  33.27 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  34.17 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 552 aa  280  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  35.29 
 
 		 521 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 571 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  34.68 
 
 		 515 aa  276  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  33.78 
 
 		 533 aa  276  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 571 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  35.17 
 
 		 527 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  34.65 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 555 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 552 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 609 aa  268  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 551 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 530 aa  267  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  33.85 
 
 		 524 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 548 aa  266  7e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 555 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  33.78 
 
 		 532 aa  266  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 		 546 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  33.66 
 
 		 517 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  33.66 
 
 		 524 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 566 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 539 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 539 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 530 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  34.41 
 
 		 550 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  34.99 
 
 		 518 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  33.96 
 
 		 526 aa  261  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  33.66 
 
 		 524 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 557 aa  259  9e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  30.81 
 
 		 568 aa  259  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  33.02 
 
 		 532 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  30.81 
 
 		 568 aa  259  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  33.93 
 
 		 513 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  33.33 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 538 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 572 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 572 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 572 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 572 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  32.31 
 
 		 531 aa  256  6e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 572 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 572 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 572 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 572 aa  256  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 572 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  32.5 
 
 		 530 aa  256  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 567 aa  256  9e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 554 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 537 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.77 
 
 		 582 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  32.95 
 
 		 572 aa  253  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.58 
 
 		 561 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>