More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2033 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  100 
 
 
541 aa  1098    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  91.31 
 
 
541 aa  999    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  99.63 
 
 
541 aa  1095    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  99.45 
 
 
541 aa  1092    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  72.42 
 
 
551 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  72.28 
 
 
551 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  55.41 
 
 
539 aa  593  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  54.21 
 
 
539 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  53.12 
 
 
548 aa  558  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  52.52 
 
 
567 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  54.04 
 
 
553 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  56.9 
 
 
539 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  52.8 
 
 
543 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  53.27 
 
 
538 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  53.27 
 
 
538 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  52.22 
 
 
546 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  52.81 
 
 
529 aa  528  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  49.53 
 
 
542 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  51.33 
 
 
546 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  50.37 
 
 
546 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  50.18 
 
 
546 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  49.54 
 
 
545 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  50.54 
 
 
557 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  48.68 
 
 
546 aa  492  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  48.53 
 
 
542 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  48.15 
 
 
546 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  47.57 
 
 
547 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  48.78 
 
 
542 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  46.72 
 
 
539 aa  458  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  46.82 
 
 
538 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 
546 aa  347  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  35.98 
 
 
528 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  33.78 
 
 
525 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  36.35 
 
 
521 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 
549 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  35.25 
 
 
549 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  35.7 
 
 
527 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  36.26 
 
 
519 aa  260  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  34.29 
 
 
528 aa  257  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  34.17 
 
 
553 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  35.55 
 
 
517 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  34.22 
 
 
533 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 
506 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  35.36 
 
 
526 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  34.59 
 
 
531 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  32.95 
 
 
519 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  31.73 
 
 
523 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  33.72 
 
 
515 aa  241  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  36.23 
 
 
518 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 
511 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  34.27 
 
 
524 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  34.62 
 
 
518 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  34.45 
 
 
532 aa  236  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  33.27 
 
 
524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  33.02 
 
 
524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  33.89 
 
 
527 aa  233  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
539 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  33.71 
 
 
541 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
539 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  33.68 
 
 
503 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 
530 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  35.07 
 
 
550 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 
552 aa  227  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  31.78 
 
 
532 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 
548 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  30.31 
 
 
586 aa  225  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  29.28 
 
 
531 aa  223  6e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  32.82 
 
 
530 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  33.61 
 
 
501 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 
537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  33.15 
 
 
531 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  31.71 
 
 
535 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  34.24 
 
 
513 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 
549 aa  217  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 
537 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
571 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 
530 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
609 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 
528 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  39.2 
 
 
503 aa  213  9e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  30.79 
 
 
528 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 
528 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  30.58 
 
 
528 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  30.37 
 
 
528 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  30.58 
 
 
528 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  28.6 
 
 
568 aa  209  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  28.6 
 
 
568 aa  209  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  30.58 
 
 
522 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  30.17 
 
 
528 aa  209  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  30.37 
 
 
522 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  30.58 
 
 
528 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 
506 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  32.12 
 
 
554 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  30.37 
 
 
528 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 
546 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 
508 aa  207  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  31.66 
 
 
549 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  28.38 
 
 
572 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  28.38 
 
 
572 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 
555 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>