More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2688 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  58.27 
 
 		 538 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  69.7 
 
 		 546 aa  781    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  62.08 
 
 		 542 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  62.87 
 
 		 539 aa  694    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  58.27 
 
 		 538 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  100 
 
 		 567 aa  1167    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  57.83 
 
 		 543 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  57.79 
 
 		 539 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  57.46 
 
 		 553 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  59.96 
 
 		 539 aa  615  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  57.69 
 
 		 548 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  56.35 
 
 		 546 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  55.8 
 
 		 546 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  55.35 
 
 		 545 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  56.27 
 
 		 546 aa  601  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  55.51 
 
 		 529 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  55.76 
 
 		 538 aa  585  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  55.24 
 
 		 539 aa  581  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  53.35 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  54.88 
 
 		 542 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  53.75 
 
 		 546 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  52.71 
 
 		 541 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  52.52 
 
 		 541 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  52.52 
 
 		 541 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  52.15 
 
 		 541 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  51.67 
 
 		 551 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  51.6 
 
 		 546 aa  545  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  52.04 
 
 		 551 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  51.87 
 
 		 542 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  51.49 
 
 		 547 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  45.59 
 
 		 546 aa  451  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  37.86 
 
 		 525 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  37.38 
 
 		 523 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  37.6 
 
 		 528 aa  335  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 		 549 aa  330  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  36.54 
 
 		 519 aa  325  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  36.15 
 
 		 527 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  36.49 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  37.15 
 
 		 521 aa  300  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  37.55 
 
 		 528 aa  300  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  36.21 
 
 		 586 aa  298  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  36.72 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 		 506 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 539 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 539 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  36.27 
 
 		 517 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  36.28 
 
 		 533 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  35.48 
 
 		 526 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  36.65 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 555 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 530 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  38.12 
 
 		 550 aa  283  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 566 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  36.45 
 
 		 531 aa  282  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  36.55 
 
 		 527 aa  282  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  36.17 
 
 		 518 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  36.35 
 
 		 515 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  34.27 
 
 		 503 aa  279  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 609 aa  277  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  34.08 
 
 		 532 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  35 
 
 		 524 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  35.01 
 
 		 524 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 548 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  35.8 
 
 		 532 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  33.4 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  34.77 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 		 539 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  35.14 
 
 		 519 aa  267  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  34.94 
 
 		 524 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  35.73 
 
 		 518 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 551 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.95 
 
 		 528 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 539 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 539 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  33.65 
 
 		 563 aa  262  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  33.89 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.77 
 
 		 528 aa  261  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 528 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 539 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 528 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 539 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  34.97 
 
 		 522 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  32.87 
 
 		 521 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  34.76 
 
 		 522 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  34.96 
 
 		 528 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  33.98 
 
 		 530 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  35.33 
 
 		 528 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 528 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 512 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  32.88 
 
 		 535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 552 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  32.5 
 
 		 568 aa  254  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>