More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4177 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
546 aa  1107    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  45.59 
 
 
567 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  43.31 
 
 
539 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  43.39 
 
 
542 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  42.46 
 
 
546 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  41.91 
 
 
546 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 
543 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  41.86 
 
 
545 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  41.56 
 
 
553 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  42.03 
 
 
546 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  42.67 
 
 
546 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 
548 aa  412  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 
538 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 
538 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  41.53 
 
 
538 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  41 
 
 
539 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  40.29 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 
539 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  43.31 
 
 
539 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
546 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 
529 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 
542 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  39.46 
 
 
557 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 
549 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  38.93 
 
 
547 aa  364  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  39.63 
 
 
542 aa  361  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  40.56 
 
 
541 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  39.26 
 
 
551 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 
551 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  39.07 
 
 
541 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  39.07 
 
 
541 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  39.07 
 
 
541 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  38.95 
 
 
525 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  40.66 
 
 
513 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  37.36 
 
 
519 aa  326  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  39.17 
 
 
527 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  36.64 
 
 
523 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  36.85 
 
 
528 aa  307  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  36.28 
 
 
549 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 
560 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  35.88 
 
 
533 aa  296  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 
537 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  36.01 
 
 
518 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  35.58 
 
 
531 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  36.9 
 
 
532 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  36.22 
 
 
553 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  35.73 
 
 
517 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  36.44 
 
 
527 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  34.85 
 
 
528 aa  282  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  34.71 
 
 
521 aa  279  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  36.03 
 
 
532 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  36.49 
 
 
550 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 
530 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  35.69 
 
 
526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  32.91 
 
 
629 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 
530 aa  273  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  31.83 
 
 
629 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 
528 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  34.98 
 
 
524 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  34.09 
 
 
528 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  36.28 
 
 
515 aa  270  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  35.82 
 
 
531 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  34.28 
 
 
528 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  33.91 
 
 
568 aa  270  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  33.91 
 
 
568 aa  270  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  34.16 
 
 
522 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  34.09 
 
 
528 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  31.96 
 
 
572 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  34.09 
 
 
528 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.9 
 
 
528 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  33.9 
 
 
528 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
552 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.63 
 
 
561 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 
528 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 
522 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  33.59 
 
 
522 aa  264  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.95 
 
 
563 aa  264  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.72 
 
 
582 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 
561 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  32.12 
 
 
572 aa  264  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.76 
 
 
563 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  34.34 
 
 
524 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 
539 aa  263  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 
561 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 
539 aa  263  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  33.65 
 
 
528 aa  263  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  31.88 
 
 
572 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
548 aa  262  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 
563 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.44 
 
 
561 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 
563 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  30.8 
 
 
625 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  34.72 
 
 
530 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 
582 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  34.92 
 
 
530 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  31.69 
 
 
572 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  31.69 
 
 
572 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 
558 aa  261  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>