More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0011 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
560 aa  1139    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  44.67 
 
 
571 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  44.04 
 
 
572 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  44.06 
 
 
572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  44.06 
 
 
572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  44.06 
 
 
572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  44.06 
 
 
572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  44.06 
 
 
572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  44.06 
 
 
572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  43.88 
 
 
572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  43.88 
 
 
572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  44.06 
 
 
572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  44.06 
 
 
572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  43.86 
 
 
571 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  42.31 
 
 
568 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  42.31 
 
 
568 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  41.68 
 
 
537 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  40.48 
 
 
552 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 
552 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  41.01 
 
 
587 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  43.97 
 
 
607 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  41.47 
 
 
588 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  41.47 
 
 
588 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  40.9 
 
 
584 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  41.45 
 
 
598 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  42.25 
 
 
558 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  42.09 
 
 
522 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  41.01 
 
 
588 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  39.29 
 
 
598 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  40.14 
 
 
585 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  39.39 
 
 
592 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  39.89 
 
 
584 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  40.89 
 
 
602 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  38.93 
 
 
588 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  39.68 
 
 
588 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  38.6 
 
 
576 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  41.86 
 
 
525 aa  360  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  39.36 
 
 
562 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  40.18 
 
 
576 aa  352  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 
609 aa  352  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  40.18 
 
 
555 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  40 
 
 
555 aa  349  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 
566 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4369  AMP-dependent synthetase and ligase  41.09 
 
 
542 aa  348  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 
535 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 
539 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  38.82 
 
 
553 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  37.95 
 
 
535 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 
530 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 
539 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 
539 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  38.56 
 
 
528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  38.19 
 
 
528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 
530 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  38.56 
 
 
528 aa  336  5e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 
555 aa  337  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  38.56 
 
 
528 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 
567 aa  336  5.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  38.56 
 
 
528 aa  336  7e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  38.56 
 
 
522 aa  336  7e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 
555 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 
539 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  38.37 
 
 
528 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 
528 aa  334  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 
539 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  38.19 
 
 
522 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
555 aa  333  4e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  38.19 
 
 
528 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 
528 aa  333  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 
557 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  37.72 
 
 
563 aa  333  6e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 
539 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 
539 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 
539 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 
535 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  38.6 
 
 
548 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
552 aa  332  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  39.71 
 
 
555 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  39 
 
 
563 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 
555 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
532 aa  331  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  39.71 
 
 
555 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  40.74 
 
 
538 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 
557 aa  330  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 
544 aa  329  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 
562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  36.49 
 
 
586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  38.95 
 
 
556 aa  327  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  36.5 
 
 
541 aa  327  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 
539 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 
561 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 
595 aa  326  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 
567 aa  325  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 
548 aa  324  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 
554 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 
555 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 
549 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  39.5 
 
 
555 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 
562 aa  323  6e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 
553 aa  323  6e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>