More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7028 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  76.62 
 
 		 588 aa  900    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  63.78 
 
 		 576 aa  701    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  61.72 
 
 		 584 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  70.94 
 
 		 587 aa  826    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  80.85 
 
 		 588 aa  947    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  62.86 
 
 		 598 aa  711    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  69.49 
 
 		 602 aa  815    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 585 aa  1187    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  69.83 
 
 		 592 aa  829    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  76.62 
 
 		 588 aa  900    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  61.93 
 
 		 588 aa  687    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  62.29 
 
 		 607 aa  707    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  58.68 
 
 		 588 aa  671    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  60.6 
 
 		 584 aa  706    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  63.5 
 
 		 598 aa  747    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  47.89 
 
 		 568 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  47.89 
 
 		 568 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  48.34 
 
 		 571 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  47.64 
 
 		 571 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  45.95 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  46.06 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  45.77 
 
 		 572 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  45.77 
 
 		 572 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  49.63 
 
 		 553 aa  488  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  46.17 
 
 		 539 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2650  AMP-dependent synthetase and ligase  43.21 
 
 		 553 aa  405  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  42.18 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  41.5 
 
 		 632 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  38.86 
 
 		 625 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  43.18 
 
 		 631 aa  393  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  43.01 
 
 		 629 aa  391  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  40.53 
 
 		 629 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  40.43 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  41.32 
 
 		 629 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  42.05 
 
 		 631 aa  385  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  40.54 
 
 		 632 aa  382  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  41 
 
 		 670 aa  381  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  42.07 
 
 		 653 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  40.92 
 
 		 638 aa  375  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  39.36 
 
 		 632 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  39.54 
 
 		 631 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  39.54 
 
 		 632 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  40.14 
 
 		 560 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  40.5 
 
 		 648 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  42 
 
 		 656 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  40.14 
 
 		 639 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  38.98 
 
 		 657 aa  372  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  39.08 
 
 		 638 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  39.15 
 
 		 667 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  39.96 
 
 		 639 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  38.91 
 
 		 652 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  38.61 
 
 		 652 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  39.96 
 
 		 629 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  40.79 
 
 		 652 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  40.5 
 
 		 655 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  40.95 
 
 		 659 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  41.1 
 
 		 651 aa  369  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  40.18 
 
 		 644 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  39.03 
 
 		 667 aa  367  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  39.33 
 
 		 667 aa  365  1e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  39.46 
 
 		 631 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  37.33 
 
 		 664 aa  364  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  38.64 
 
 		 632 aa  365  2e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  38.51 
 
 		 666 aa  364  2e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  39.25 
 
 		 650 aa  363  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  38.45 
 
 		 666 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  39.96 
 
 		 660 aa  362  9e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  38.45 
 
 		 667 aa  360  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  37.88 
 
 		 626 aa  360  5e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  37.85 
 
 		 652 aa  359  9e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  40.2 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  39.37 
 
 		 650 aa  359  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  38.92 
 
 		 658 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 		 627 aa  356  6.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 552 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  39.45 
 
 		 651 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  40.67 
 
 		 661 aa  353  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  39.86 
 
 		 643 aa  353  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  39.27 
 
 		 655 aa  353  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  38.59 
 
 		 656 aa  353  7e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  38.46 
 
 		 661 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  39.12 
 
 		 650 aa  351  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  37.3 
 
 		 658 aa  351  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2222  acetate--CoA ligase  40.92 
 
 		 648 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  39.72 
 
 		 655 aa  351  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  38.18 
 
 		 653 aa  350  5e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  37.3 
 
 		 658 aa  349  7e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5208  acetyl-CoA synthetase  40.45 
 
 		 649 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  40.6 
 
 		 644 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4783  acetyl-CoA synthetase  40.45 
 
 		 649 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  40.3 
 
 		 667 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  38.73 
 
 		 654 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  39.53 
 
 		 649 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>