More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1413 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  49.3 
 
 
655 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  52.4 
 
 
649 aa  649    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  50.39 
 
 
650 aa  654    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  50.62 
 
 
653 aa  667    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  47.94 
 
 
657 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  50.98 
 
 
656 aa  652    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  50.93 
 
 
650 aa  666    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  51.07 
 
 
651 aa  647    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  51.98 
 
 
631 aa  637    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  47.85 
 
 
664 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  52.02 
 
 
660 aa  692    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  47.79 
 
 
657 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  51.32 
 
 
643 aa  645    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  48.34 
 
 
656 aa  653    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  50.82 
 
 
661 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  48.82 
 
 
652 aa  641    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  49.16 
 
 
655 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  48.16 
 
 
664 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  50.68 
 
 
656 aa  666    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  50.16 
 
 
660 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  65.7 
 
 
659 aa  937    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  65.36 
 
 
670 aa  934    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  64.82 
 
 
660 aa  917    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  100 
 
 
656 aa  1348    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  51.44 
 
 
656 aa  655    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  50.38 
 
 
648 aa  661    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
667 aa  638    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  47.95 
 
 
666 aa  632  1e-180  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  51.31 
 
 
659 aa  630  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  49.6 
 
 
654 aa  629  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  47.02 
 
 
658 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  50.08 
 
 
667 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  51.07 
 
 
658 aa  629  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  50.08 
 
 
656 aa  626  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  48.46 
 
 
661 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  49.24 
 
 
644 aa  626  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  51.43 
 
 
632 aa  628  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  49.84 
 
 
661 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  49.1 
 
 
658 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 
644 aa  622  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  49.84 
 
 
655 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  48.03 
 
 
632 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  47.87 
 
 
632 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  49.43 
 
 
674 aa  618  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  48.34 
 
 
652 aa  618  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  46.92 
 
 
649 aa  618  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  48.94 
 
 
658 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  46.79 
 
 
649 aa  621  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  47.72 
 
 
631 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  50.76 
 
 
625 aa  618  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  49.08 
 
 
652 aa  619  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  46.58 
 
 
658 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  50.65 
 
 
657 aa  619  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  47.4 
 
 
631 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  49.59 
 
 
680 aa  615  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  48.01 
 
 
652 aa  616  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  51.01 
 
 
629 aa  617  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  49.59 
 
 
649 aa  616  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  50.08 
 
 
651 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  48.5 
 
 
652 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  50.23 
 
 
629 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  50.33 
 
 
670 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  47.81 
 
 
639 aa  608  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  47.39 
 
 
666 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  48.22 
 
 
638 aa  610  1e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  48.2 
 
 
673 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  45.51 
 
 
666 aa  610  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  48.53 
 
 
657 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  49.83 
 
 
629 aa  609  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  49.32 
 
 
629 aa  608  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  48.93 
 
 
668 aa  611  1e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  47.39 
 
 
660 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  47.61 
 
 
667 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  49.36 
 
 
638 aa  609  1e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  47.39 
 
 
660 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  50.82 
 
 
663 aa  611  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  46.85 
 
 
661 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  47.79 
 
 
656 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  45.4 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  45.95 
 
 
660 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  49.11 
 
 
655 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  51.57 
 
 
632 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  50.49 
 
 
670 aa  606  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  49.58 
 
 
639 aa  605  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  49.11 
 
 
655 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  50.59 
 
 
632 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  44.79 
 
 
660 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  49.68 
 
 
661 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  48.73 
 
 
654 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  49.84 
 
 
651 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 
653 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  51.42 
 
 
626 aa  604  1.0000000000000001e-171  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  49.52 
 
 
676 aa  605  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  48.72 
 
 
667 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  47.22 
 
 
657 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  46.78 
 
 
649 aa  599  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  48.27 
 
 
655 aa  598  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  48.44 
 
 
631 aa  600  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  50.57 
 
 
661 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  44.89 
 
 
660 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>