More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_992 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  51.39 
 
 		 631 aa  667    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  51.58 
 
 		 666 aa  680    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  96.93 
 
 		 652 aa  1313    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  50.7 
 
 		 674 aa  644    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  50.93 
 
 		 664 aa  697    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  50.65 
 
 		 649 aa  646    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 		 655 aa  641    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  98.16 
 
 		 652 aa  1325    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  51.43 
 
 		 656 aa  641    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  48.56 
 
 		 658 aa  643    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  47.07 
 
 		 660 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  55.97 
 
 		 668 aa  711    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  53.36 
 
 		 666 aa  702    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  51.57 
 
 		 657 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  48.56 
 
 		 658 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  49.46 
 
 		 663 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  54.79 
 
 		 670 aa  704    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  55.95 
 
 		 666 aa  741    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  51.11 
 
 		 667 aa  671    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  49.44 
 
 		 673 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.27 
 
 		 666 aa  687    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 652 aa  1347    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  50.65 
 
 		 661 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  54.94 
 
 		 638 aa  739    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  50.89 
 
 		 649 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  52.17 
 
 		 656 aa  687    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  50.08 
 
 		 667 aa  636    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  51.34 
 
 		 631 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  50.73 
 
 		 653 aa  646    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  50.66 
 
 		 629 aa  649    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  49.34 
 
 		 629 aa  642    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  49.36 
 
 		 661 aa  642    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  51.34 
 
 		 632 aa  662    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  52.54 
 
 		 644 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  52.55 
 
 		 660 aa  682    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  49.68 
 
 		 649 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  51.82 
 
 		 655 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  50.72 
 
 		 664 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  49.63 
 
 		 692 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  50.49 
 
 		 650 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  51.53 
 
 		 654 aa  646    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  47.83 
 
 		 658 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  50.63 
 
 		 652 aa  673    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  51.48 
 
 		 655 aa  660    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 		 667 aa  686    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  51.51 
 
 		 632 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  53.04 
 
 		 636 aa  702    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  50.08 
 
 		 644 aa  651    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  52.38 
 
 		 664 aa  687    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  51.94 
 
 		 655 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  51.44 
 
 		 655 aa  681    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  50.08 
 
 		 658 aa  635    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  50.72 
 
 		 664 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  52.5 
 
 		 648 aa  690    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  52.18 
 
 		 661 aa  667    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  52.22 
 
 		 656 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  50.49 
 
 		 650 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  53.07 
 
 		 643 aa  703    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  53.48 
 
 		 646 aa  638    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  51.4 
 
 		 667 aa  641    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  52.22 
 
 		 657 aa  695    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  52.31 
 
 		 656 aa  696    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  52.56 
 
 		 636 aa  695    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  53.06 
 
 		 651 aa  671    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  52.58 
 
 		 659 aa  645    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  52.9 
 
 		 670 aa  652    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  52.16 
 
 		 660 aa  654    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  49.14 
 
 		 649 aa  656    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  50.39 
 
 		 652 aa  679    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  60.57 
 
 		 656 aa  828    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  48.72 
 
 		 657 aa  639    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  50.73 
 
 		 657 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  51.79 
 
 		 667 aa  693    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  57.97 
 
 		 638 aa  758    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  51.8 
 
 		 649 aa  688    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  52.09 
 
 		 663 aa  670    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  57.1 
 
 		 667 aa  738    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  53.28 
 
 		 661 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  53.91 
 
 		 660 aa  694    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  52.28 
 
 		 656 aa  703    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  50.81 
 
 		 661 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  50.81 
 
 		 715 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  53.04 
 
 		 636 aa  701    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  48.76 
 
 		 658 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 		 657 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 		 662 aa  632  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  48.45 
 
 		 654 aa  632  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  49.43 
 
 		 657 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  48.18 
 
 		 663 aa  628  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 		 661 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  49.35 
 
 		 647 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  50.17 
 
 		 625 aa  631  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  50.58 
 
 		 629 aa  630  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  53.73 
 
 		 653 aa  629  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  52.22 
 
 		 651 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  47.34 
 
 		 660 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  48.97 
 
 		 666 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  49.13 
 
 		 660 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  49.13 
 
 		 660 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  48.06 
 
 		 632 aa  624  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>