More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1195 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  52.91 
 
 
668 aa  642    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  53.86 
 
 
644 aa  685    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  54.17 
 
 
663 aa  685    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  53.23 
 
 
652 aa  653    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  55.35 
 
 
651 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
666 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  52.58 
 
 
631 aa  675    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  49.39 
 
 
660 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  54.03 
 
 
639 aa  651    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  53.73 
 
 
653 aa  731    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  52.17 
 
 
658 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  51.8 
 
 
715 aa  666    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.38 
 
 
664 aa  688    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  52.51 
 
 
632 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  51.28 
 
 
661 aa  661    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
654 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
656 aa  671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  50.91 
 
 
658 aa  687    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  52.88 
 
 
632 aa  661    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  51.29 
 
 
655 aa  647    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  47.87 
 
 
664 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  52.73 
 
 
657 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  54.32 
 
 
643 aa  714    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  52.23 
 
 
664 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  53.95 
 
 
651 aa  640    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  48.8 
 
 
660 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 
667 aa  648    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  51.83 
 
 
673 aa  694    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  48.5 
 
 
666 aa  654    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  51.74 
 
 
657 aa  681    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  49.33 
 
 
659 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.3 
 
 
661 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  49.08 
 
 
653 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  50.62 
 
 
651 aa  639    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  50.45 
 
 
660 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  51.97 
 
 
656 aa  687    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  53.54 
 
 
635 aa  639    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  50.91 
 
 
655 aa  661    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  52.51 
 
 
631 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  54.39 
 
 
632 aa  675    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  52.4 
 
 
652 aa  648    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  53.51 
 
 
670 aa  643    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  54.64 
 
 
629 aa  665    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  49.55 
 
 
660 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  53.12 
 
 
629 aa  651    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  52.35 
 
 
632 aa  670    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  49.54 
 
 
654 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  50.15 
 
 
657 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
654 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  51.86 
 
 
638 aa  656    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 
667 aa  654    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  51.89 
 
 
657 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.83 
 
 
649 aa  686    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  56.23 
 
 
629 aa  653    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  54.11 
 
 
654 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  55.56 
 
 
632 aa  659    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  50.76 
 
 
658 aa  685    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  49.7 
 
 
660 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  49.55 
 
 
660 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  52.83 
 
 
652 aa  704    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  51.31 
 
 
655 aa  666    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  52.33 
 
 
626 aa  653    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  50.31 
 
 
646 aa  641    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
660 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  54.55 
 
 
644 aa  700    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  51.41 
 
 
664 aa  652    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  55.31 
 
 
629 aa  660    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.19 
 
 
655 aa  710    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  52.09 
 
 
650 aa  693    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  50.37 
 
 
660 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  49.62 
 
 
649 aa  651    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  53.02 
 
 
661 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  52.85 
 
 
655 aa  685    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 
666 aa  643    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  53.57 
 
 
660 aa  709    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  52.52 
 
 
658 aa  689    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  51.21 
 
 
667 aa  692    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  50.15 
 
 
657 aa  667    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  80.48 
 
 
659 aa  1091    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  100 
 
 
670 aa  1384    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  74.58 
 
 
660 aa  1039    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  65.36 
 
 
656 aa  934    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  54.79 
 
 
631 aa  640    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  53.88 
 
 
656 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  52.2 
 
 
656 aa  689    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  50.91 
 
 
655 aa  661    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  51.22 
 
 
657 aa  671    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 
667 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  55.88 
 
 
638 aa  688    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  51.13 
 
 
664 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  51.5 
 
 
639 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  52.77 
 
 
667 aa  669    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
660 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  50.22 
 
 
660 aa  678    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  51.85 
 
 
666 aa  672    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  53.22 
 
 
670 aa  651    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  51.66 
 
 
661 aa  693    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4507  acetate/CoA ligase  51.99 
 
 
663 aa  646    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424676  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  54.7 
 
 
631 aa  663    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  49.78 
 
 
658 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>