More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4043 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  57.42 
 
 		 673 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  93.19 
 
 		 661 aa  1275    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  51.13 
 
 		 652 aa  637    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 		 660 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  53.98 
 
 		 657 aa  717    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  52.04 
 
 		 655 aa  684    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  50.98 
 
 		 660 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  56.64 
 
 		 643 aa  741    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  48.32 
 
 		 657 aa  637    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  49.92 
 
 		 638 aa  664    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  52.04 
 
 		 660 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  49.7 
 
 		 660 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 		 660 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  54.98 
 
 		 655 aa  738    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  50.84 
 
 		 654 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  69.05 
 
 		 656 aa  950    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  52.44 
 
 		 658 aa  710    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  48.64 
 
 		 660 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  53.96 
 
 		 655 aa  702    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.3 
 
 		 657 aa  729    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 		 660 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.21 
 
 		 657 aa  700    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 		 660 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  54.17 
 
 		 667 aa  713    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  52.04 
 
 		 660 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.9 
 
 		 667 aa  704    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  54.49 
 
 		 673 aa  715    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.98 
 
 		 666 aa  724    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  54.88 
 
 		 657 aa  706    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  50.91 
 
 		 654 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.54 
 
 		 661 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  51.68 
 
 		 653 aa  690    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.06 
 
 		 660 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.52 
 
 		 660 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.38 
 
 		 656 aa  742    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  50.38 
 
 		 660 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  51.13 
 
 		 660 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  55.03 
 
 		 664 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  56.15 
 
 		 667 aa  677    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  66.46 
 
 		 653 aa  849    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.13 
 
 		 660 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  54.02 
 
 		 658 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 715 aa  1460    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  48.62 
 
 		 657 aa  638    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  50.38 
 
 		 666 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  51.05 
 
 		 664 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  50.45 
 
 		 654 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.87 
 
 		 656 aa  722    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  50.76 
 
 		 660 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 		 660 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  51.35 
 
 		 680 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  54 
 
 		 649 aa  734    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  64.45 
 
 		 651 aa  842    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  52.04 
 
 		 655 aa  684    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  66.56 
 
 		 654 aa  865    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  49.7 
 
 		 660 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  55.54 
 
 		 652 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  55.34 
 
 		 655 aa  726    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 		 664 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  52.11 
 
 		 660 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  66.93 
 
 		 660 aa  879    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.36 
 
 		 644 aa  722    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.15 
 
 		 658 aa  732    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  57.6 
 
 		 660 aa  758    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  53.35 
 
 		 664 aa  720    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.9 
 
 		 655 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  57.27 
 
 		 656 aa  745    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  66.93 
 
 		 666 aa  879    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  51.38 
 
 		 645 aa  642    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 		 660 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 		 660 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  52.04 
 
 		 660 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  51.05 
 
 		 664 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 		 660 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  52.27 
 
 		 660 aa  663    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  53.72 
 
 		 670 aa  670    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  65.87 
 
 		 673 aa  843    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  65.47 
 
 		 676 aa  865    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  52.11 
 
 		 660 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 		 664 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  50.81 
 
 		 652 aa  639    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.8 
 
 		 670 aa  666    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  49.77 
 
 		 660 aa  657    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  52.37 
 
 		 660 aa  703    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 		 664 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  51.34 
 
 		 656 aa  647    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  50.61 
 
 		 644 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  50.45 
 
 		 657 aa  651    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  67.62 
 
 		 657 aa  923    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  53.93 
 
 		 667 aa  722    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  53.38 
 
 		 663 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  69.42 
 
 		 664 aa  917    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  52.11 
 
 		 660 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  53.75 
 
 		 649 aa  695    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  66.93 
 
 		 660 aa  879    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  52.13 
 
 		 658 aa  704    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  66.16 
 
 		 663 aa  865    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  51.71 
 
 		 661 aa  652    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  50.63 
 
 		 631 aa  638    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  49.85 
 
 		 664 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>