More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0701 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  53.72 
 
 		 655 aa  696    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  55.67 
 
 		 655 aa  694    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  51.99 
 
 		 666 aa  678    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  54.93 
 
 		 652 aa  733    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  51.24 
 
 		 632 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  52.71 
 
 		 661 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  50.32 
 
 		 660 aa  645    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  51.98 
 
 		 655 aa  645    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  55.63 
 
 		 651 aa  690    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  51.23 
 
 		 674 aa  652    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  52.36 
 
 		 660 aa  669    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  53.33 
 
 		 664 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  51.2 
 
 		 656 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  51.62 
 
 		 658 aa  660    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  52.39 
 
 		 646 aa  652    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.41 
 
 		 657 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  52.44 
 
 		 657 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 		 667 aa  691    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  51.94 
 
 		 658 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  54.74 
 
 		 661 aa  685    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.17 
 
 		 667 aa  676    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  52.95 
 
 		 673 aa  656    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  53 
 
 		 666 aa  689    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  52.49 
 
 		 657 aa  651    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  55.65 
 
 		 648 aa  709    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  50.99 
 
 		 653 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  52.12 
 
 		 664 aa  690    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  50.79 
 
 		 660 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.59 
 
 		 656 aa  696    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  51.69 
 
 		 636 aa  678    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  50.98 
 
 		 660 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  51.08 
 
 		 631 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  51.09 
 
 		 653 aa  635    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  54.93 
 
 		 664 aa  695    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 		 715 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  54.2 
 
 		 653 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  54.79 
 
 		 650 aa  677    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  52.4 
 
 		 670 aa  658    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  51.64 
 
 		 658 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  50.08 
 
 		 680 aa  639    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  52.17 
 
 		 649 aa  664    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  52.13 
 
 		 658 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  51.31 
 
 		 667 aa  642    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  52.17 
 
 		 649 aa  698    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  55.25 
 
 		 657 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  51.08 
 
 		 632 aa  654    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  50.32 
 
 		 660 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  55.05 
 
 		 666 aa  709    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  51.62 
 
 		 649 aa  659    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.84 
 
 		 652 aa  697    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  53.77 
 
 		 655 aa  684    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  52.17 
 
 		 636 aa  684    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  55.11 
 
 		 652 aa  736    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53.96 
 
 		 644 aa  669    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  53.09 
 
 		 663 aa  679    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 		 657 aa  683    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  55.76 
 
 		 655 aa  693    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  50.89 
 
 		 661 aa  661    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  51.15 
 
 		 655 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  51.24 
 
 		 631 aa  647    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  51.15 
 
 		 655 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  55.02 
 
 		 643 aa  710    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  51.11 
 
 		 663 aa  657    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  54.49 
 
 		 652 aa  702    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  51.45 
 
 		 676 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  55.87 
 
 		 670 aa  696    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  53.22 
 
 		 649 aa  682    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  50.98 
 
 		 651 aa  648    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.86 
 
 		 670 aa  656    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  51.94 
 
 		 660 aa  656    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  49.59 
 
 		 658 aa  655    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  51.37 
 
 		 651 aa  643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  55.52 
 
 		 656 aa  740    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  51.69 
 
 		 636 aa  679    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.04 
 
 		 667 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  56.06 
 
 		 638 aa  720    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  54.53 
 
 		 660 aa  704    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  52.86 
 
 		 666 aa  701    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  53.33 
 
 		 667 aa  705    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  52.73 
 
 		 659 aa  659    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  100 
 
 		 638 aa  1310    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  52.6 
 
 		 649 aa  685    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  52.11 
 
 		 656 aa  676    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  50.73 
 
 		 656 aa  667    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  55.01 
 
 		 656 aa  686    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  53.95 
 
 		 650 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  54.66 
 
 		 668 aa  699    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  52.63 
 
 		 664 aa  679    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  54.94 
 
 		 652 aa  739    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  51.56 
 
 		 650 aa  634  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  50.49 
 
 		 667 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  49.11 
 
 		 658 aa  633  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  49.02 
 
 		 657 aa  631  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  49.84 
 
 		 663 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  50.33 
 
 		 629 aa  630  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  51.77 
 
 		 673 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  50.08 
 
 		 661 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33450  acetyl-coenzyme A synthetase  50 
 
 		 662 aa  627  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  52.1 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  50.58 
 
 		 645 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>