More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0256 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  53.69 
 
 
636 aa  686    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  51.82 
 
 
664 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  66.62 
 
 
666 aa  926    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  52.76 
 
 
652 aa  695    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  54.47 
 
 
636 aa  688    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  51.85 
 
 
653 aa  651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  54.42 
 
 
692 aa  741    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  51.44 
 
 
657 aa  644    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  54.1 
 
 
644 aa  659    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  49.6 
 
 
639 aa  647    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  51.43 
 
 
657 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  70.85 
 
 
668 aa  954    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  50 
 
 
652 aa  638    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  51.58 
 
 
656 aa  660    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  50.85 
 
 
631 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  50.83 
 
 
657 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.1 
 
 
664 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  54.03 
 
 
651 aa  663    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  53.06 
 
 
652 aa  698    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  54.36 
 
 
648 aa  676    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  50.39 
 
 
657 aa  643    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.01 
 
 
661 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  53.53 
 
 
636 aa  686    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  50.98 
 
 
656 aa  649    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  51.55 
 
 
631 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  55.05 
 
 
638 aa  709    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  52.96 
 
 
660 aa  674    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  49.45 
 
 
667 aa  635    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
666 aa  1352    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  52.46 
 
 
667 aa  656    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  65.81 
 
 
664 aa  899    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  55.5 
 
 
661 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  51.42 
 
 
650 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  52.68 
 
 
655 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  52.75 
 
 
652 aa  661    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  52.32 
 
 
644 aa  635    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.06 
 
 
655 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  54.23 
 
 
656 aa  672    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  52.11 
 
 
643 aa  639    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  69.85 
 
 
670 aa  941    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  49.09 
 
 
664 aa  644    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  51.55 
 
 
632 aa  643    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  51.71 
 
 
632 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  51.42 
 
 
650 aa  652    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  50.31 
 
 
670 aa  643    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  51.07 
 
 
660 aa  650    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  53.36 
 
 
652 aa  702    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  54.33 
 
 
656 aa  712    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  53.99 
 
 
660 aa  658    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 
667 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  60.93 
 
 
638 aa  789    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  51.38 
 
 
649 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  69.77 
 
 
667 aa  984    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  50.48 
 
 
639 aa  652    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  51.52 
 
 
649 aa  665    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  68.62 
 
 
666 aa  969    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.5 
 
 
661 aa  660    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  50.47 
 
 
655 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  50.47 
 
 
655 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  50.48 
 
 
666 aa  634  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  53.43 
 
 
661 aa  632  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  50.62 
 
 
649 aa  632  1e-180  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.71 
 
 
667 aa  629  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  52.93 
 
 
655 aa  631  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  51.22 
 
 
680 aa  628  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  52.17 
 
 
661 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  48.61 
 
 
652 aa  622  1e-177  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
653 aa  622  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  48.57 
 
 
649 aa  623  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  53.37 
 
 
657 aa  624  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  49.6 
 
 
663 aa  619  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  50.94 
 
 
663 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  49.77 
 
 
629 aa  619  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  51.47 
 
 
661 aa  621  1e-176  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  51.53 
 
 
715 aa  620  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  50.16 
 
 
659 aa  618  1e-176  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  48.72 
 
 
660 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  53.02 
 
 
654 aa  615  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  47.72 
 
 
648 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  48.87 
 
 
658 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  49.61 
 
 
660 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  49.85 
 
 
654 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  48.98 
 
 
658 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  48.55 
 
 
657 aa  609  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  51.5 
 
 
655 aa  610  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  53.72 
 
 
667 aa  610  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  51.43 
 
 
660 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  53.73 
 
 
674 aa  609  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  49.47 
 
 
650 aa  611  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  51.43 
 
 
660 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  50.97 
 
 
658 aa  611  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  49.13 
 
 
658 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
661 aa  607  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  49.84 
 
 
629 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  50.16 
 
 
660 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  51.43 
 
 
666 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  49.16 
 
 
660 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  48.99 
 
 
658 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 
661 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  51.53 
 
 
629 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>