More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1721 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  50.49 
 
 
639 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  52.02 
 
 
660 aa  651    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  49.67 
 
 
652 aa  642    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  50.82 
 
 
636 aa  640    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  55.43 
 
 
648 aa  705    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  50.47 
 
 
643 aa  642    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  51.37 
 
 
649 aa  639    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  50.16 
 
 
636 aa  635    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  67.88 
 
 
632 aa  925    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  51.1 
 
 
649 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  52.74 
 
 
658 aa  651    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  67.41 
 
 
632 aa  917    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  50.24 
 
 
657 aa  658    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  53.34 
 
 
657 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  52.64 
 
 
658 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
667 aa  645    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  50.94 
 
 
673 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.67 
 
 
666 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  51.41 
 
 
657 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  52.39 
 
 
632 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.49 
 
 
661 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  52.85 
 
 
649 aa  658    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  50.49 
 
 
639 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  51.72 
 
 
656 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  50.95 
 
 
627 aa  640    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  54.11 
 
 
651 aa  678    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  52.6 
 
 
651 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  52.55 
 
 
631 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  51.35 
 
 
663 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  79.49 
 
 
629 aa  1077    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  62.04 
 
 
625 aa  836    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  100 
 
 
629 aa  1298    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  53.57 
 
 
644 aa  665    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  65.77 
 
 
631 aa  883    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  49.34 
 
 
652 aa  642    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  50.63 
 
 
649 aa  647    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  69 
 
 
629 aa  925    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  53.77 
 
 
650 aa  666    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  51.72 
 
 
658 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  50.54 
 
 
667 aa  641    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  52.74 
 
 
658 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  52.15 
 
 
652 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  52.55 
 
 
636 aa  658    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.05 
 
 
655 aa  670    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  53.83 
 
 
664 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  55.09 
 
 
656 aa  681    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  68.23 
 
 
631 aa  913    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.26 
 
 
655 aa  678    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  51.99 
 
 
650 aa  658    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  52.77 
 
 
650 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  66.45 
 
 
629 aa  909    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  57.05 
 
 
632 aa  719    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  50.94 
 
 
660 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  51.5 
 
 
664 aa  672    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  53.21 
 
 
659 aa  637    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  53.12 
 
 
670 aa  651    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  53.99 
 
 
664 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  51.07 
 
 
656 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  49.68 
 
 
652 aa  660    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  53.5 
 
 
653 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.79 
 
 
667 aa  661    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  52.55 
 
 
632 aa  687    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  54.95 
 
 
626 aa  712    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  52.65 
 
 
638 aa  645    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  65.66 
 
 
635 aa  888    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  50.4 
 
 
667 aa  659    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  52.9 
 
 
656 aa  677    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  50.87 
 
 
661 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  54 
 
 
655 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  51.25 
 
 
660 aa  648    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  48.85 
 
 
652 aa  638    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  51.52 
 
 
631 aa  674    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  53.12 
 
 
657 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  51.84 
 
 
660 aa  632  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  52.18 
 
 
667 aa  634  1e-180  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  48.45 
 
 
657 aa  628  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  49.84 
 
 
636 aa  631  1e-179  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  51.17 
 
 
660 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  52.92 
 
 
658 aa  630  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  50.16 
 
 
656 aa  629  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  51.86 
 
 
666 aa  628  1e-179  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  49.2 
 
 
655 aa  626  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  50.47 
 
 
660 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  51.17 
 
 
661 aa  624  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  53.57 
 
 
661 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.07 
 
 
660 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  47.55 
 
 
638 aa  620  1e-176  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  49.3 
 
 
655 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  49.3 
 
 
655 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  52.09 
 
 
644 aa  617  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  49.84 
 
 
654 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  52.84 
 
 
670 aa  614  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  50.32 
 
 
661 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  50.82 
 
 
662 aa  611  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  48.67 
 
 
657 aa  609  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  48.61 
 
 
715 aa  608  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  49.84 
 
 
666 aa  608  1e-173  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  49.38 
 
 
661 aa  611  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  50.86 
 
 
668 aa  610  1e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  49.32 
 
 
656 aa  608  1e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>