More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4434 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0731  acetyl-CoA synthetase  52.01 
 
 
644 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40572  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  56.92 
 
 
643 aa  734    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 
664 aa  653    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  55.82 
 
 
657 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  52 
 
 
644 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  56.84 
 
 
673 aa  700    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  51.51 
 
 
660 aa  643    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 
660 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  55.29 
 
 
655 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 
655 aa  670    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 
660 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  58.4 
 
 
656 aa  734    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 
660 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  66.77 
 
 
654 aa  860    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  50.91 
 
 
654 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  67.83 
 
 
656 aa  934    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  52.74 
 
 
658 aa  713    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  49.32 
 
 
660 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  53.88 
 
 
655 aa  701    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.3 
 
 
657 aa  722    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 
660 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.36 
 
 
657 aa  698    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  51.91 
 
 
660 aa  695    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  51.06 
 
 
660 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  52.64 
 
 
660 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.75 
 
 
667 aa  691    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  55.24 
 
 
673 aa  721    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  53.91 
 
 
666 aa  716    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.93 
 
 
657 aa  711    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  54.5 
 
 
664 aa  728    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.63 
 
 
661 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  52.29 
 
 
653 aa  694    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.21 
 
 
660 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.08 
 
 
656 aa  736    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
664 aa  708    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  51.13 
 
 
660 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  52.85 
 
 
667 aa  648    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  56.57 
 
 
667 aa  675    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  93.19 
 
 
715 aa  1275    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  50.68 
 
 
654 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  52.15 
 
 
644 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  54.63 
 
 
658 aa  738    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  53.7 
 
 
667 aa  701    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  52.13 
 
 
655 aa  670    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  53.36 
 
 
657 aa  706    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  51.36 
 
 
657 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  51.36 
 
 
654 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  50.97 
 
 
665 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  57.45 
 
 
660 aa  746    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  50.15 
 
 
660 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  53.08 
 
 
649 aa  718    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  51.14 
 
 
658 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
663 aa  693    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
661 aa  1345    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  66.77 
 
 
653 aa  849    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  50.53 
 
 
660 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  55.69 
 
 
652 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  55.4 
 
 
655 aa  723    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 
664 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  52.04 
 
 
660 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  66.15 
 
 
660 aa  864    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  55.88 
 
 
644 aa  708    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 
660 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  51.06 
 
 
660 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4701  acetyl-CoA synthetase  52.31 
 
 
644 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120403  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  55.66 
 
 
655 aa  733    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.43 
 
 
658 aa  730    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  52.28 
 
 
658 aa  707    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  51.85 
 
 
645 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  51.95 
 
 
664 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  52.94 
 
 
660 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  51.95 
 
 
664 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  66.15 
 
 
666 aa  863    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  52.19 
 
 
660 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  53.32 
 
 
670 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  65.72 
 
 
673 aa  830    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  65.47 
 
 
676 aa  856    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  52.04 
 
 
660 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 
664 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  52.04 
 
 
660 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.28 
 
 
670 aa  661    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  50.3 
 
 
660 aa  661    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 
660 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  52.49 
 
 
660 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  51.61 
 
 
656 aa  643    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  50.91 
 
 
644 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  51.73 
 
 
660 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  67.62 
 
 
657 aa  915    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  53.28 
 
 
667 aa  705    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  50.87 
 
 
638 aa  640    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  68.07 
 
 
664 aa  894    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.32 
 
 
656 aa  716    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  53.95 
 
 
649 aa  704    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  66.15 
 
 
660 aa  864    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.67 
 
 
660 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  65.04 
 
 
663 aa  850    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.01 
 
 
661 aa  652    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  50.89 
 
 
638 aa  661    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  50.15 
 
 
664 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  63.35 
 
 
651 aa  827    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>