More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4702 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05626  Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1)(Acetate--CoA ligase)(Acyl-activating enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P16928]  53.39 
 
 		 670 aa  678    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0101756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  60.31 
 
 		 652 aa  840    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  60.31 
 
 		 652 aa  841    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  64.24 
 
 		 651 aa  815    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  64.36 
 
 		 653 aa  865    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 644 aa  1332    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  67.61 
 
 		 662 aa  922    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.52 
 
 		 660 aa  668    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  64.99 
 
 		 648 aa  900    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  53.45 
 
 		 658 aa  685    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  63.68 
 
 		 651 aa  868    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  59.66 
 
 		 650 aa  841    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  63.58 
 
 		 651 aa  858    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  64.56 
 
 		 653 aa  863    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  56.63 
 
 		 652 aa  743    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0126  hypothetical protein  55.85 
 
 		 652 aa  740    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07740  acetate--CoA ligase, putative  54.95 
 
 		 680 aa  647    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.534841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  63.89 
 
 		 651 aa  860    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0184  acetyl-CoA synthetase  56.07 
 
 		 653 aa  753    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  64.68 
 
 		 644 aa  882    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  53.37 
 
 		 656 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53.61 
 
 		 658 aa  688    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  63.68 
 
 		 651 aa  867    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.62 
 
 		 655 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  64.58 
 
 		 652 aa  874    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  56.37 
 
 		 657 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  59.66 
 
 		 650 aa  843    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.06 
 
 		 656 aa  685    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  65.57 
 
 		 651 aa  877    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  81.71 
 
 		 645 aa  1113    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  63.26 
 
 		 653 aa  827    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  67.58 
 
 		 650 aa  882    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 		 667 aa  654    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  55.87 
 
 		 673 aa  699    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 		 666 aa  667    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.09 
 
 		 657 aa  678    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  58.47 
 
 		 661 aa  748    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.12 
 
 		 653 aa  676    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  51.85 
 
 		 651 aa  635    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.94 
 
 		 660 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  53.97 
 
 		 656 aa  693    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  67.61 
 
 		 646 aa  902    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  54.83 
 
 		 649 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 		 666 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  63.26 
 
 		 653 aa  827    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  66.77 
 
 		 652 aa  891    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  64.11 
 
 		 649 aa  871    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  64.01 
 
 		 645 aa  831    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  69.01 
 
 		 645 aa  950    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  66.29 
 
 		 647 aa  890    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  53.38 
 
 		 654 aa  666    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.65 
 
 		 660 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  52.24 
 
 		 636 aa  694    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  51.79 
 
 		 660 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  60.87 
 
 		 651 aa  850    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  49.53 
 
 		 649 aa  637    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  67.9 
 
 		 650 aa  898    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  63.82 
 
 		 649 aa  865    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  64.74 
 
 		 652 aa  872    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  55.92 
 
 		 655 aa  771    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  63.1 
 
 		 649 aa  880    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  53.7 
 
 		 652 aa  696    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  53.76 
 
 		 655 aa  676    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  63.3 
 
 		 652 aa  828    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  62.32 
 
 		 654 aa  786    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79135  Acyl-CoA synthetase 2 (ACS2)  51.81 
 
 		 679 aa  668    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89873  acetyl-coenzyme A synthetase (Acetate--CoA ligase 1) (Acyl-activating enzyme 1)  52.15 
 
 		 675 aa  665    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00976511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 		 660 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  55.93 
 
 		 644 aa  707    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  62.62 
 
 		 646 aa  855    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  66.62 
 
 		 654 aa  905    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  53.4 
 
 		 631 aa  696    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  55.77 
 
 		 655 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  59.81 
 
 		 650 aa  843    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  59.81 
 
 		 650 aa  844    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  68.84 
 
 		 645 aa  957    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  59.6 
 
 		 650 aa  845    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  64.65 
 
 		 651 aa  862    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  80 
 
 		 645 aa  1084    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  63.26 
 
 		 653 aa  829    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  64.05 
 
 		 651 aa  868    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  78.45 
 
 		 645 aa  1070    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  60.06 
 
 		 650 aa  831    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  59.5 
 
 		 650 aa  838    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  65.72 
 
 		 650 aa  908    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  55.62 
 
 		 658 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  68.17 
 
 		 644 aa  945    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  59.97 
 
 		 650 aa  845    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  53.81 
 
 		 657 aa  650    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.39 
 
 		 667 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  63.19 
 
 		 651 aa  820    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  63.19 
 
 		 651 aa  820    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  59.01 
 
 		 652 aa  834    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  67.29 
 
 		 645 aa  934    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  62.26 
 
 		 650 aa  857    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 		 660 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  60.62 
 
 		 649 aa  840    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  54.44 
 
 		 644 aa  678    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  65.33 
 
 		 649 aa  889    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  57.33 
 
 		 661 aa  726    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>