More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1451 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  52.88 
 
 		 653 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 		 660 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  66.46 
 
 		 657 aa  934    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  50.86 
 
 		 645 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  51.85 
 
 		 644 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.56 
 
 		 662 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  55.45 
 
 		 660 aa  729    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  54.86 
 
 		 648 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  66.15 
 
 		 657 aa  929    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 651 aa  655    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  51.22 
 
 		 651 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1863  acetyl-CoA synthetase  50.46 
 
 		 650 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.579141  normal  0.108064 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 		 660 aa  717    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.58 
 
 		 656 aa  690    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  52.68 
 
 		 664 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  56.04 
 
 		 654 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  54.02 
 
 		 645 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.33 
 
 		 658 aa  707    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  55.21 
 
 		 660 aa  722    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  55.33 
 
 		 655 aa  735    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  50.46 
 
 		 650 aa  636    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.14 
 
 		 657 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 		 660 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  54.1 
 
 		 657 aa  727    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  50.91 
 
 		 651 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  51.65 
 
 		 645 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  52.88 
 
 		 653 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  54.31 
 
 		 660 aa  710    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  52.67 
 
 		 647 aa  660    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  54.76 
 
 		 673 aa  711    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  50.15 
 
 		 654 aa  643    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  53.67 
 
 		 657 aa  692    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.63 
 
 		 661 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  56.41 
 
 		 653 aa  729    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 651 aa  1343    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  54.5 
 
 		 660 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.23 
 
 		 656 aa  723    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  53.11 
 
 		 646 aa  661    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  53.91 
 
 		 660 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  56.24 
 
 		 633 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  51.3 
 
 		 652 aa  638    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  50.08 
 
 		 649 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  53.33 
 
 		 645 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  54.63 
 
 		 665 aa  711    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  53.62 
 
 		 645 aa  649    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  51.07 
 
 		 647 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  55.8 
 
 		 654 aa  733    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  54.75 
 
 		 665 aa  721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  52.95 
 
 		 658 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  53.6 
 
 		 660 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 651 aa  656    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  51.91 
 
 		 650 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  51.45 
 
 		 650 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  51.78 
 
 		 649 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  51.93 
 
 		 653 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  66 
 
 		 657 aa  922    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  55.52 
 
 		 660 aa  732    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  50.47 
 
 		 652 aa  663    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  49.07 
 
 		 655 aa  641    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  54.31 
 
 		 652 aa  653    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  53.59 
 
 		 665 aa  716    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  53.81 
 
 		 664 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  53.87 
 
 		 660 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  54.21 
 
 		 658 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  52.77 
 
 		 649 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  54.04 
 
 		 660 aa  696    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 		 654 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  53.99 
 
 		 645 aa  667    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.22 
 
 		 655 aa  699    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  51.97 
 
 		 645 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  51.74 
 
 		 651 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  53.86 
 
 		 645 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 		 660 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  52.98 
 
 		 651 aa  648    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  54.46 
 
 		 660 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  53.66 
 
 		 664 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  51.74 
 
 		 651 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  52.33 
 
 		 645 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 		 660 aa  717    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  53.87 
 
 		 660 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  53.81 
 
 		 664 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  53.7 
 
 		 660 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  50.62 
 
 		 670 aa  639    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.49 
 
 		 658 aa  710    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  52.53 
 
 		 650 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  54.99 
 
 		 664 aa  724    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  54.39 
 
 		 644 aa  673    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 		 650 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 		 660 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  49.37 
 
 		 667 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  54.47 
 
 		 651 aa  662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  54.47 
 
 		 651 aa  662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  56.26 
 
 		 657 aa  724    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  52.4 
 
 		 644 aa  643    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 		 652 aa  654    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 		 660 aa  717    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  51.55 
 
 		 649 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  54.11 
 
 		 660 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  51.99 
 
 		 649 aa  658    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.02 
 
 		 661 aa  652    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>