More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2625 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05626  Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1)(Acetate--CoA ligase)(Acyl-activating enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P16928]  52.17 
 
 
670 aa  657    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0101756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  66.93 
 
 
652 aa  914    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  66.77 
 
 
652 aa  912    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  67.71 
 
 
653 aa  920    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  64.11 
 
 
644 aa  871    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  64.54 
 
 
662 aa  865    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 
660 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  60.9 
 
 
648 aa  843    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  66.25 
 
 
650 aa  922    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  69.18 
 
 
651 aa  946    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  66.41 
 
 
650 aa  923    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  66.67 
 
 
651 aa  919    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  70.3 
 
 
650 aa  953    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  54.65 
 
 
652 aa  679    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0126  hypothetical protein  54.49 
 
 
652 aa  680    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  65.94 
 
 
653 aa  910    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  66.2 
 
 
651 aa  914    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0184  acetyl-CoA synthetase  55.66 
 
 
653 aa  757    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  65.79 
 
 
650 aa  921    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  52.33 
 
 
656 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  52.24 
 
 
658 aa  668    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  53.35 
 
 
660 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.72 
 
 
655 aa  658    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  68.17 
 
 
652 aa  948    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  53.74 
 
 
657 aa  666    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  51.92 
 
 
656 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  51.23 
 
 
657 aa  658    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  66.51 
 
 
651 aa  902    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  63.91 
 
 
645 aa  837    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  66.25 
 
 
653 aa  908    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  65.16 
 
 
650 aa  909    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
667 aa  647    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  53.31 
 
 
673 aa  662    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  50.55 
 
 
666 aa  661    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  54.15 
 
 
657 aa  655    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  59.27 
 
 
661 aa  775    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  52.71 
 
 
653 aa  683    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
651 aa  652    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  49.85 
 
 
660 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  53.49 
 
 
656 aa  675    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  72.6 
 
 
646 aa  975    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  64.95 
 
 
645 aa  866    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  53.86 
 
 
633 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  71.54 
 
 
652 aa  983    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 
649 aa  1342    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  63.71 
 
 
652 aa  905    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  51.89 
 
 
664 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  66.77 
 
 
645 aa  879    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  68.26 
 
 
649 aa  937    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  64.8 
 
 
645 aa  882    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  70.3 
 
 
647 aa  961    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  55.29 
 
 
654 aa  684    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  50.46 
 
 
660 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  69.83 
 
 
651 aa  941    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  52.15 
 
 
636 aa  692    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  66.87 
 
 
651 aa  925    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  54.02 
 
 
644 aa  690    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  71.07 
 
 
650 aa  974    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  66.72 
 
 
649 aa  914    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  68.17 
 
 
652 aa  944    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  55.97 
 
 
655 aa  775    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  52.69 
 
 
660 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  53.63 
 
 
652 aa  676    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
655 aa  659    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  66.2 
 
 
652 aa  879    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  65.07 
 
 
654 aa  856    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  52.24 
 
 
658 aa  667    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  49.61 
 
 
660 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  65.99 
 
 
652 aa  912    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53.93 
 
 
644 aa  679    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  63.41 
 
 
646 aa  866    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  68.43 
 
 
654 aa  930    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  55.74 
 
 
631 aa  726    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  52.17 
 
 
655 aa  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  66.25 
 
 
650 aa  923    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  66.41 
 
 
650 aa  923    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  66.67 
 
 
645 aa  901    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  65.32 
 
 
650 aa  914    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  69.05 
 
 
651 aa  911    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  67.59 
 
 
653 aa  925    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  69.18 
 
 
651 aa  947    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  66.36 
 
 
651 aa  926    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  65.05 
 
 
645 aa  880    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  53 
 
 
658 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  49.61 
 
 
660 aa  637    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  68.88 
 
 
650 aa  965    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  66.09 
 
 
645 aa  890    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  66.51 
 
 
644 aa  910    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  66.25 
 
 
650 aa  924    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  52.24 
 
 
657 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.55 
 
 
667 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  64.22 
 
 
651 aa  865    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  64.22 
 
 
651 aa  865    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  53.08 
 
 
664 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  54.87 
 
 
649 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  66.87 
 
 
650 aa  929    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  71.59 
 
 
644 aa  964    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  66.09 
 
 
649 aa  913    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  66.25 
 
 
653 aa  909    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  69.41 
 
 
649 aa  955    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>