More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4550 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05626  Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1)(Acetate--CoA ligase)(Acyl-activating enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P16928]  52.1 
 
 		 670 aa  656    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0101756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  62.21 
 
 		 652 aa  819    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  62.21 
 
 		 652 aa  819    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  62.96 
 
 		 653 aa  822    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  63.19 
 
 		 644 aa  820    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  61.73 
 
 		 662 aa  796    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  63.65 
 
 		 651 aa  826    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  62.54 
 
 		 648 aa  819    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  79.87 
 
 		 653 aa  1078    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  67.8 
 
 		 651 aa  894    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  62.11 
 
 		 650 aa  824    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  64.9 
 
 		 651 aa  833    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00169  acetyl-CoA synthetase  61.21 
 
 		 682 aa  800    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  56.09 
 
 		 652 aa  670    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0126  hypothetical protein  55.61 
 
 		 652 aa  666    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  65.55 
 
 		 645 aa  833    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  63.58 
 
 		 651 aa  825    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0184  acetyl-CoA synthetase  54.4 
 
 		 653 aa  688    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79135  Acyl-CoA synthetase 2 (ACS2)  50.23 
 
 		 679 aa  645    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.4 
 
 		 656 aa  635    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  62.21 
 
 		 652 aa  819    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  55.66 
 
 		 649 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  53.16 
 
 		 655 aa  643    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  67.51 
 
 		 652 aa  882    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  54.27 
 
 		 657 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  62.21 
 
 		 652 aa  819    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.85 
 
 		 657 aa  656    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  63.2 
 
 		 651 aa  820    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  62.46 
 
 		 645 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  78.77 
 
 		 653 aa  1065    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0624  acetyl-CoA synthetase  56.72 
 
 		 651 aa  738    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3006  acetate--CoA ligase  60.82 
 
 		 652 aa  795    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.972893 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  54.52 
 
 		 673 aa  637    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  67.55 
 
 		 649 aa  859    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  68.25 
 
 		 650 aa  874    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  58.82 
 
 		 661 aa  740    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.01 
 
 		 653 aa  660    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  54.47 
 
 		 651 aa  662    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  67.65 
 
 		 651 aa  890    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.8 
 
 		 656 aa  662    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  67.76 
 
 		 646 aa  885    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  62.96 
 
 		 653 aa  822    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  61.07 
 
 		 650 aa  824    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  68.4 
 
 		 652 aa  883    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  64.22 
 
 		 649 aa  865    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  61.95 
 
 		 650 aa  823    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  61.76 
 
 		 652 aa  833    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  72.59 
 
 		 645 aa  980    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89873  acetyl-coenzyme A synthetase (Acetate--CoA ligase 1) (Acyl-activating enzyme 1)  50.08 
 
 		 675 aa  639    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00976511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  66.15 
 
 		 645 aa  863    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  68.4 
 
 		 647 aa  890    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  54.92 
 
 		 654 aa  648    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  78.77 
 
 		 653 aa  1066    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  61.64 
 
 		 650 aa  819    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01635  acetyl-CoA synthase  58.94 
 
 		 653 aa  762    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  61.02 
 
 		 651 aa  818    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  65.37 
 
 		 645 aa  843    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  68.72 
 
 		 650 aa  883    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  62.15 
 
 		 649 aa  831    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  66.72 
 
 		 652 aa  872    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  53.63 
 
 		 655 aa  699    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  62.2 
 
 		 649 aa  802    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  52.48 
 
 		 652 aa  645    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  66.25 
 
 		 644 aa  867    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  74.76 
 
 		 652 aa  970    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  64.03 
 
 		 654 aa  812    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  62.02 
 
 		 652 aa  823    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  54.8 
 
 		 644 aa  682    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  70.3 
 
 		 647 aa  913    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.43 
 
 		 644 aa  671    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  60.59 
 
 		 646 aa  796    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  67.5 
 
 		 654 aa  876    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  54.19 
 
 		 631 aa  691    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  62.32 
 
 		 651 aa  809    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  62.42 
 
 		 650 aa  827    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  62.26 
 
 		 650 aa  827    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  65.53 
 
 		 645 aa  846    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  61.76 
 
 		 650 aa  816    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  67.36 
 
 		 651 aa  860    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  63.26 
 
 		 645 aa  813    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  63.55 
 
 		 645 aa  833    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  62.32 
 
 		 651 aa  808    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  63.41 
 
 		 645 aa  816    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  62.21 
 
 		 652 aa  824    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  69.24 
 
 		 651 aa  894    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  64.54 
 
 		 650 aa  853    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  54.2 
 
 		 658 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  63.91 
 
 		 644 aa  825    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  62.26 
 
 		 650 aa  828    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  62.32 
 
 		 653 aa  811    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1863  acetyl-CoA synthetase  61.82 
 
 		 650 aa  823    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.579141  normal  0.108064 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  100 
 
 		 651 aa  1343    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  100 
 
 		 651 aa  1345    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  68.12 
 
 		 651 aa  887    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  59.51 
 
 		 650 aa  810    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  63.19 
 
 		 644 aa  818    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  63.41 
 
 		 649 aa  823    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  61.64 
 
 		 650 aa  819    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  64.85 
 
 		 649 aa  872    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  58.04 
 
 		 661 aa  726    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>