More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2856 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  53.61 
 
 		 645 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  51.31 
 
 		 644 aa  638    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  50.16 
 
 		 652 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  53.53 
 
 		 644 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  53.37 
 
 		 644 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 662 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  52.58 
 
 		 660 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  66.98 
 
 		 651 aa  877    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  50.38 
 
 		 657 aa  652    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 		 651 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  69.05 
 
 		 715 aa  950    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  52.5 
 
 		 657 aa  667    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  61.1 
 
 		 656 aa  797    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.8 
 
 		 661 aa  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  53.03 
 
 		 654 aa  670    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 656 aa  1345    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.52 
 
 		 658 aa  728    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  52.66 
 
 		 660 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  53.05 
 
 		 655 aa  694    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  52.7 
 
 		 645 aa  638    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  54.68 
 
 		 657 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  52.07 
 
 		 657 aa  684    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  52.38 
 
 		 645 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.4 
 
 		 656 aa  708    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  52.27 
 
 		 660 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  53.56 
 
 		 667 aa  692    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  54.27 
 
 		 673 aa  705    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  53.69 
 
 		 666 aa  707    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  53.25 
 
 		 657 aa  691    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  54.48 
 
 		 661 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.25 
 
 		 653 aa  702    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  52.34 
 
 		 651 aa  638    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  54.07 
 
 		 660 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.7 
 
 		 656 aa  724    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  52.77 
 
 		 646 aa  651    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 660 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  52.04 
 
 		 664 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  56.63 
 
 		 667 aa  683    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  52.41 
 
 		 651 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  52.33 
 
 		 649 aa  644    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.69 
 
 		 658 aa  729    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  56.61 
 
 		 673 aa  681    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  71.76 
 
 		 653 aa  940    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  51.54 
 
 		 654 aa  675    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  51.13 
 
 		 665 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  52.39 
 
 		 658 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  52.87 
 
 		 660 aa  670    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.76 
 
 		 660 aa  708    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  54.33 
 
 		 649 aa  725    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  52.38 
 
 		 650 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  51.77 
 
 		 649 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  54.21 
 
 		 658 aa  698    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.79 
 
 		 645 aa  666    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  52.27 
 
 		 660 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  57.08 
 
 		 652 aa  721    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  55.04 
 
 		 655 aa  716    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 		 657 aa  654    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 		 657 aa  645    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 664 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  70.06 
 
 		 660 aa  941    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  55.43 
 
 		 644 aa  706    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  52.56 
 
 		 654 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.79 
 
 		 655 aa  706    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  70.06 
 
 		 666 aa  941    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  53.39 
 
 		 653 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  52.71 
 
 		 645 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  54.05 
 
 		 660 aa  726    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  52.88 
 
 		 660 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  52.42 
 
 		 664 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  52.77 
 
 		 647 aa  645    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  53.19 
 
 		 645 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  55.4 
 
 		 670 aa  706    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  64.9 
 
 		 673 aa  816    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  65.36 
 
 		 676 aa  856    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 664 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2558  acetyl-CoA synthetase  53.45 
 
 		 650 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  52.74 
 
 		 670 aa  671    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  51.14 
 
 		 660 aa  648    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 		 651 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  51.16 
 
 		 650 aa  647    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  52.17 
 
 		 656 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  52.41 
 
 		 644 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  52.46 
 
 		 651 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  66.82 
 
 		 657 aa  902    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  53.56 
 
 		 667 aa  703    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  52.22 
 
 		 633 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  68.78 
 
 		 664 aa  907    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  53.97 
 
 		 645 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  54.22 
 
 		 660 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  70.06 
 
 		 660 aa  941    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  71.14 
 
 		 663 aa  948    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>