More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1385 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.93 
 
 		 661 aa  652    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  53.79 
 
 		 652 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  53.63 
 
 		 652 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3553  acetyl-coenzyme A synthetase  54.77 
 
 		 658 aa  656    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  54.57 
 
 		 647 aa  654    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  75.51 
 
 		 660 aa  1028    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  77.18 
 
 		 660 aa  1027    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  53.79 
 
 		 652 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  54.96 
 
 		 657 aa  691    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  75.51 
 
 		 660 aa  1028    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  78.57 
 
 		 660 aa  1053    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  52.76 
 
 		 644 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  75.51 
 
 		 660 aa  1028    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 		 645 aa  646    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  55.12 
 
 		 657 aa  693    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  78.25 
 
 		 654 aa  1043    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  52.22 
 
 		 656 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  56.26 
 
 		 658 aa  719    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  76.7 
 
 		 660 aa  1031    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  67.88 
 
 		 655 aa  889    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  54.33 
 
 		 657 aa  686    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.84 
 
 		 657 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  75.51 
 
 		 660 aa  1028    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  61.17 
 
 		 657 aa  788    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  77.02 
 
 		 660 aa  1019    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  53.54 
 
 		 652 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  54.87 
 
 		 653 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  77.02 
 
 		 660 aa  1033    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2562  acetyl-CoA synthetase  53.3 
 
 		 649 aa  656    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.732738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  57.1 
 
 		 673 aa  714    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 		 666 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.36 
 
 		 657 aa  683    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  56.15 
 
 		 661 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  63.33 
 
 		 653 aa  815    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  56.24 
 
 		 651 aa  709    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  55.08 
 
 		 660 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.15 
 
 		 656 aa  707    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  55.84 
 
 		 646 aa  659    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  75.2 
 
 		 660 aa  1022    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  74.53 
 
 		 664 aa  1002    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  54.72 
 
 		 653 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  54.17 
 
 		 652 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  53.86 
 
 		 649 aa  639    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  72.99 
 
 		 664 aa  978    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  53.22 
 
 		 645 aa  635    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  71.99 
 
 		 665 aa  974    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.87 
 
 		 656 aa  685    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  54.96 
 
 		 647 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  66.3 
 
 		 654 aa  871    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  73.26 
 
 		 665 aa  997    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  72.7 
 
 		 658 aa  997    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  74.68 
 
 		 660 aa  1011    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  54.56 
 
 		 653 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  77.22 
 
 		 657 aa  1048    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  53.86 
 
 		 652 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  53.55 
 
 		 649 aa  642    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  53.92 
 
 		 651 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.15 
 
 		 658 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  78.76 
 
 		 660 aa  1055    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  56.94 
 
 		 652 aa  705    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  55.17 
 
 		 655 aa  674    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  53.54 
 
 		 652 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 		 633 aa  1303    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  76.42 
 
 		 664 aa  1026    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  76.7 
 
 		 660 aa  1028    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  53.79 
 
 		 652 aa  654    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  54.9 
 
 		 644 aa  662    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  54.37 
 
 		 660 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  53.61 
 
 		 654 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  75.51 
 
 		 660 aa  1028    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.74 
 
 		 655 aa  667    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2558  acetyl-CoA synthetase  53.15 
 
 		 650 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0297  acetyl-CoA synthetase  54.62 
 
 		 652 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.447688  hitchhiker  0.000249841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  53.79 
 
 		 645 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  55.54 
 
 		 658 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  75.51 
 
 		 660 aa  1028    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  76.78 
 
 		 660 aa  1034    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  76.74 
 
 		 664 aa  1032    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  53.7 
 
 		 652 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  54.05 
 
 		 645 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  54.62 
 
 		 660 aa  680    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  75.51 
 
 		 660 aa  1028    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  76.7 
 
 		 660 aa  1028    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  76.42 
 
 		 664 aa  1026    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  75.51 
 
 		 664 aa  1014    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1399  acetate--CoA ligase  54.77 
 
 		 653 aa  656    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570682  normal  0.412853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  53.87 
 
 		 650 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  74.09 
 
 		 665 aa  1004    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  53.48 
 
 		 644 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  52.68 
 
 		 650 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  54.25 
 
 		 657 aa  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 		 667 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  54.81 
 
 		 654 aa  648    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  53.32 
 
 		 649 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  56.1 
 
 		 658 aa  712    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  54.27 
 
 		 645 aa  656    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  77.02 
 
 		 680 aa  1019    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  74.57 
 
 		 666 aa  1002    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  53.16 
 
 		 649 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  54.46 
 
 		 660 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>