More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3378 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  54.73 
 
 
673 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  51.86 
 
 
660 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  51.38 
 
 
652 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.08 
 
 
660 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.02 
 
 
660 aa  717    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  51.27 
 
 
660 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  50.82 
 
 
660 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  52.82 
 
 
633 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
657 aa  649    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  52.08 
 
 
660 aa  673    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  51.56 
 
 
657 aa  672    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  50.52 
 
 
666 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  51.94 
 
 
660 aa  663    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  51.35 
 
 
638 aa  665    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 
654 aa  664    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  65.66 
 
 
656 aa  890    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  55.2 
 
 
658 aa  736    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  52.08 
 
 
660 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  54.33 
 
 
655 aa  701    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  56.46 
 
 
657 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  51.94 
 
 
660 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.53 
 
 
657 aa  699    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  60.76 
 
 
651 aa  804    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  52.78 
 
 
663 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  51.79 
 
 
660 aa  670    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.96 
 
 
667 aa  690    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  55.71 
 
 
673 aa  733    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.34 
 
 
666 aa  702    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.96 
 
 
657 aa  731    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  53.09 
 
 
666 aa  638    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  51.88 
 
 
661 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  54.74 
 
 
653 aa  726    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  51.04 
 
 
680 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.47 
 
 
660 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.78 
 
 
656 aa  743    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  51.94 
 
 
660 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  51.79 
 
 
660 aa  663    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  52.09 
 
 
660 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  56.77 
 
 
667 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 
657 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  51.94 
 
 
660 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  51.56 
 
 
664 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  51.33 
 
 
634 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  50.97 
 
 
665 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  55.81 
 
 
656 aa  714    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  55.06 
 
 
658 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  52.25 
 
 
654 aa  681    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  51.19 
 
 
665 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  52.5 
 
 
658 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  51.41 
 
 
660 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  52.23 
 
 
664 aa  675    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.06 
 
 
649 aa  687    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.9 
 
 
658 aa  726    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  52.47 
 
 
658 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  63.82 
 
 
666 aa  847    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  51.71 
 
 
660 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  57.27 
 
 
652 aa  737    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  56.65 
 
 
655 aa  739    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  51.34 
 
 
664 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  51.42 
 
 
664 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  51.34 
 
 
660 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  63.82 
 
 
660 aa  847    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.07 
 
 
644 aa  702    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  51.94 
 
 
660 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  51.94 
 
 
660 aa  663    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.75 
 
 
655 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  52 
 
 
664 aa  705    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  56.8 
 
 
660 aa  738    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  54.73 
 
 
649 aa  712    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  52.62 
 
 
660 aa  709    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  50.38 
 
 
657 aa  650    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  52.39 
 
 
660 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  52.23 
 
 
664 aa  675    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  55.79 
 
 
658 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  65.47 
 
 
661 aa  890    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  51.93 
 
 
660 aa  678    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  96.94 
 
 
673 aa  1225    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 
676 aa  1381    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  51.34 
 
 
660 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  51.42 
 
 
664 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  55.63 
 
 
659 aa  654    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  52.47 
 
 
670 aa  655    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  53.36 
 
 
667 aa  702    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  51.64 
 
 
660 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  63 
 
 
653 aa  825    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  52.79 
 
 
656 aa  655    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  50.58 
 
 
658 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  69.2 
 
 
654 aa  912    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  64.34 
 
 
657 aa  868    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  53.4 
 
 
667 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  52.42 
 
 
657 aa  695    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  66.22 
 
 
664 aa  856    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  51.94 
 
 
660 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  53.41 
 
 
667 aa  642    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  63.82 
 
 
660 aa  847    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  63.46 
 
 
663 aa  831    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  65.47 
 
 
715 aa  897    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  55.64 
 
 
656 aa  728    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  51.11 
 
 
665 aa  643    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  50.45 
 
 
664 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>