More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1068 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  55.16 
 
 		 644 aa  646    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  53.18 
 
 		 657 aa  684    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  50.46 
 
 		 657 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  56.96 
 
 		 658 aa  734    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  58.39 
 
 		 650 aa  697    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.29 
 
 		 664 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  53.78 
 
 		 660 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  50.41 
 
 		 660 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  58.42 
 
 		 667 aa  742    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  51.99 
 
 		 660 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  52.53 
 
 		 658 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  52.61 
 
 		 654 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  55.21 
 
 		 656 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  52.91 
 
 		 658 aa  674    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  52.33 
 
 		 656 aa  656    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  53.87 
 
 		 655 aa  680    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  54.95 
 
 		 649 aa  683    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  52.77 
 
 		 657 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  52.73 
 
 		 657 aa  686    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  54.42 
 
 		 653 aa  683    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  49.69 
 
 		 660 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  54.18 
 
 		 651 aa  666    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  52.21 
 
 		 660 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.55 
 
 		 667 aa  663    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  51.15 
 
 		 673 aa  649    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  53.02 
 
 		 666 aa  676    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  52.53 
 
 		 657 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.01 
 
 		 661 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  51.55 
 
 		 653 aa  670    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  49.53 
 
 		 660 aa  669    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  48.85 
 
 		 660 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  53.86 
 
 		 656 aa  674    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  55.11 
 
 		 661 aa  702    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  51.6 
 
 		 660 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  53.31 
 
 		 664 aa  646    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  84.25 
 
 		 667 aa  1090    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  54.49 
 
 		 666 aa  698    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  53.08 
 
 		 660 aa  670    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  56.93 
 
 		 661 aa  732    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  52.24 
 
 		 655 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  52.46 
 
 		 657 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  51.68 
 
 		 654 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  52.38 
 
 		 654 aa  653    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  52.29 
 
 		 664 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  51.28 
 
 		 664 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  49.92 
 
 		 649 aa  647    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  58.9 
 
 		 654 aa  724    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  52.69 
 
 		 658 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  52.95 
 
 		 667 aa  673    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  53.97 
 
 		 649 aa  680    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 		 660 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.9 
 
 		 652 aa  697    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  53.44 
 
 		 655 aa  655    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 		 660 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  53.54 
 
 		 649 aa  657    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  51.43 
 
 		 664 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 		 660 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  54.49 
 
 		 660 aa  698    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.66 
 
 		 644 aa  697    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4507  acetate/CoA ligase  54.72 
 
 		 663 aa  681    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  54.56 
 
 		 663 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  51.08 
 
 		 655 aa  656    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  53.1 
 
 		 664 aa  683    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  54.31 
 
 		 655 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  53.02 
 
 		 655 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  54.85 
 
 		 680 aa  706    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  52.24 
 
 		 655 aa  675    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 		 660 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  53.15 
 
 		 664 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  53.01 
 
 		 633 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  53.74 
 
 		 650 aa  679    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  54.64 
 
 		 673 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  54.73 
 
 		 676 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 		 660 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  51.43 
 
 		 664 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  55.92 
 
 		 715 aa  730    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  54.18 
 
 		 646 aa  699    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  100 
 
 		 673 aa  1355    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  50.53 
 
 		 657 aa  648    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  55.33 
 
 		 663 aa  703    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  56.53 
 
 		 657 aa  738    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  51.42 
 
 		 667 aa  678    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  55.75 
 
 		 651 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  53.17 
 
 		 643 aa  689    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  52.99 
 
 		 658 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  54.78 
 
 		 664 aa  681    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  50.92 
 
 		 658 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  54.49 
 
 		 660 aa  698    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  55.99 
 
 		 651 aa  702    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  54.91 
 
 		 663 aa  699    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  51.62 
 
 		 656 aa  660    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  51.68 
 
 		 661 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  55.4 
 
 		 670 aa  706    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  57.38 
 
 		 653 aa  704    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>