More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4507 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  54.71 
 
 		 650 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  53.44 
 
 		 644 aa  655    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  51.14 
 
 		 652 aa  640    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  52.42 
 
 		 645 aa  643    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  52.18 
 
 		 644 aa  656    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.91 
 
 		 662 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  51.76 
 
 		 660 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  50.78 
 
 		 648 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  54.17 
 
 		 660 aa  703    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  53.46 
 
 		 651 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  67.91 
 
 		 653 aa  884    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  56.46 
 
 		 656 aa  726    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 		 660 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  53.9 
 
 		 651 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  52.8 
 
 		 654 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  71.49 
 
 		 656 aa  984    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  55.45 
 
 		 658 aa  741    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  50.53 
 
 		 660 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  54.31 
 
 		 655 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  53 
 
 		 652 aa  636    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  56.05 
 
 		 657 aa  725    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 		 660 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.11 
 
 		 657 aa  695    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  54.06 
 
 		 651 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 		 645 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.76 
 
 		 660 aa  701    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  53.28 
 
 		 660 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.7 
 
 		 667 aa  701    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.44 
 
 		 673 aa  726    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  53 
 
 		 666 aa  714    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  56.6 
 
 		 657 aa  719    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  51.96 
 
 		 652 aa  650    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  54.78 
 
 		 661 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.78 
 
 		 653 aa  709    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 		 660 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.32 
 
 		 660 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.99 
 
 		 656 aa  731    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  52.46 
 
 		 646 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  52.52 
 
 		 660 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  52.34 
 
 		 644 aa  656    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  56.51 
 
 		 667 aa  676    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  53.73 
 
 		 652 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  54.03 
 
 		 645 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  51.14 
 
 		 664 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  53.69 
 
 		 645 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  52.73 
 
 		 645 aa  643    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  53.05 
 
 		 647 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  51.85 
 
 		 654 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  66.77 
 
 		 651 aa  854    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 		 660 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  51.67 
 
 		 660 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  50.46 
 
 		 650 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  55.04 
 
 		 649 aa  741    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  54.38 
 
 		 650 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  52.48 
 
 		 649 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  54.41 
 
 		 649 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 		 660 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 		 660 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  56.88 
 
 		 652 aa  734    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  57.4 
 
 		 655 aa  733    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.13 
 
 		 658 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  55.15 
 
 		 658 aa  736    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  52.28 
 
 		 664 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  52.67 
 
 		 660 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  69.33 
 
 		 660 aa  916    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  60.38 
 
 		 644 aa  753    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.65 
 
 		 645 aa  656    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  52.49 
 
 		 654 aa  643    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.96 
 
 		 655 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  70.95 
 
 		 715 aa  968    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  52.13 
 
 		 657 aa  665    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  52.7 
 
 		 645 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 		 660 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  69.33 
 
 		 666 aa  917    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  53.59 
 
 		 660 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  53.19 
 
 		 664 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  53.46 
 
 		 651 aa  647    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  53.87 
 
 		 645 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  55.12 
 
 		 670 aa  685    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  67.88 
 
 		 673 aa  848    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  67.12 
 
 		 676 aa  868    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  52.67 
 
 		 660 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  52.28 
 
 		 664 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  66.82 
 
 		 654 aa  853    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.99 
 
 		 670 aa  676    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  50.85 
 
 		 660 aa  657    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.79 
 
 		 661 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  52.97 
 
 		 650 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  52.02 
 
 		 656 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  53.01 
 
 		 644 aa  663    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  54.06 
 
 		 653 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  67.96 
 
 		 657 aa  905    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  53.85 
 
 		 667 aa  711    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  52.55 
 
 		 645 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 		 660 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  52.17 
 
 		 638 aa  645    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  69.41 
 
 		 664 aa  902    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  52.93 
 
 		 650 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.61 
 
 		 660 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  69.33 
 
 		 660 aa  916    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>