More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2230 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  52.04 
 
 		 660 aa  695    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  51.58 
 
 		 652 aa  646    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  51.42 
 
 		 652 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  77.47 
 
 		 664 aa  1077    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  51.17 
 
 		 653 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  52.92 
 
 		 644 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  52.2 
 
 		 645 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  80.15 
 
 		 660 aa  1103    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  52.76 
 
 		 650 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  51.22 
 
 		 657 aa  684    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 		 651 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  52.6 
 
 		 650 aa  658    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.26 
 
 		 656 aa  710    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  91.36 
 
 		 660 aa  1254    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  52.02 
 
 		 651 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  91.36 
 
 		 660 aa  1254    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  75.55 
 
 		 654 aa  1023    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  52.88 
 
 		 656 aa  667    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  56.16 
 
 		 658 aa  740    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  80 
 
 		 660 aa  1123    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  71.02 
 
 		 655 aa  961    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  75.11 
 
 		 657 aa  1050    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.08 
 
 		 657 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  91.36 
 
 		 660 aa  1254    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  61.74 
 
 		 657 aa  828    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  51.58 
 
 		 652 aa  646    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  51.42 
 
 		 652 aa  647    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  76.78 
 
 		 633 aa  1034    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  97.12 
 
 		 660 aa  1320    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.98 
 
 		 667 aa  672    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.75 
 
 		 673 aa  744    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.75 
 
 		 666 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  56.15 
 
 		 657 aa  719    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.61 
 
 		 661 aa  677    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  62.86 
 
 		 653 aa  833    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  54.46 
 
 		 651 aa  712    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.58 
 
 		 660 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.93 
 
 		 656 aa  729    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  52.7 
 
 		 646 aa  641    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  91.06 
 
 		 660 aa  1251    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  91.36 
 
 		 660 aa  1254    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  50.84 
 
 		 650 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 657 aa  683    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  75.53 
 
 		 665 aa  1046    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  53.13 
 
 		 647 aa  653    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  74.01 
 
 		 665 aa  1035    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  52.92 
 
 		 645 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  51.86 
 
 		 649 aa  651    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  70.06 
 
 		 654 aa  957    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  76.44 
 
 		 665 aa  1065    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  72.8 
 
 		 658 aa  1032    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  86.02 
 
 		 660 aa  1182    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  91.36 
 
 		 660 aa  1254    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  56.01 
 
 		 658 aa  734    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  51.77 
 
 		 645 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  52.84 
 
 		 649 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  91.36 
 
 		 660 aa  1254    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  51.37 
 
 		 657 aa  687    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  81.67 
 
 		 660 aa  1138    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  57.21 
 
 		 652 aa  729    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.75 
 
 		 655 aa  663    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.05 
 
 		 645 aa  658    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  91.36 
 
 		 660 aa  1254    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  95.58 
 
 		 664 aa  1293    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  95.91 
 
 		 660 aa  1303    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  52.76 
 
 		 660 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53.4 
 
 		 644 aa  660    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  52.76 
 
 		 650 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  54.19 
 
 		 654 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.57 
 
 		 655 aa  714    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  52.91 
 
 		 650 aa  661    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  52.91 
 
 		 650 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  51.67 
 
 		 645 aa  643    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  51.45 
 
 		 650 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  54.18 
 
 		 651 aa  635    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 660 aa  1352    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  97.11 
 
 		 664 aa  1312    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.34 
 
 		 660 aa  692    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  51.54 
 
 		 645 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  52.03 
 
 		 673 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  51.94 
 
 		 676 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  95.91 
 
 		 660 aa  1303    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  95.58 
 
 		 664 aa  1293    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  51.68 
 
 		 651 aa  636    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  72.53 
 
 		 664 aa  1009    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  52.15 
 
 		 650 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  52.06 
 
 		 644 aa  636    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  53.07 
 
 		 650 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  53.05 
 
 		 657 aa  659    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.45 
 
 		 667 aa  677    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  52.04 
 
 		 715 aa  661    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  51.26 
 
 		 652 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.04 
 
 		 660 aa  700    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  57.84 
 
 		 658 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  52.45 
 
 		 650 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  52.76 
 
 		 660 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  51.17 
 
 		 653 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  52.44 
 
 		 650 aa  656    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  52.76 
 
 		 666 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.34 
 
 		 661 aa  650    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>