More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5130 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  51.97 
 
 		 660 aa  691    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  50.76 
 
 		 649 aa  639    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 		 657 aa  682    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  74.25 
 
 		 665 aa  1035    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  52.21 
 
 		 650 aa  646    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  76.04 
 
 		 658 aa  1031    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  51.45 
 
 		 657 aa  674    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  80.12 
 
 		 660 aa  1099    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  92.31 
 
 		 680 aa  1247    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  51.3 
 
 		 657 aa  677    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 		 650 aa  646    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  52.46 
 
 		 650 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 		 663 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  90.7 
 
 		 660 aa  1238    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  73.89 
 
 		 634 aa  987    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  75.6 
 
 		 664 aa  1057    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  74.35 
 
 		 654 aa  1015    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 656 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  55.86 
 
 		 658 aa  728    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  79.36 
 
 		 660 aa  1112    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  69.44 
 
 		 655 aa  945    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 		 715 aa  661    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  54.64 
 
 		 657 aa  704    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  90.7 
 
 		 660 aa  1238    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  62.46 
 
 		 657 aa  832    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  99.24 
 
 		 660 aa  1337    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  74.12 
 
 		 657 aa  1039    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  55.4 
 
 		 658 aa  720    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  96.8 
 
 		 660 aa  1306    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  53.36 
 
 		 667 aa  666    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.3 
 
 		 673 aa  734    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 		 666 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.69 
 
 		 657 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.64 
 
 		 661 aa  672    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  62.14 
 
 		 653 aa  826    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  53.81 
 
 		 651 aa  701    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.27 
 
 		 660 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.86 
 
 		 656 aa  709    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  93.22 
 
 		 664 aa  1274    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  90.4 
 
 		 660 aa  1235    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  53.03 
 
 		 654 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  90.7 
 
 		 660 aa  1238    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  74.77 
 
 		 658 aa  1029    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  90.7 
 
 		 660 aa  1238    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  53.7 
 
 		 654 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  72.59 
 
 		 665 aa  1022    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  80.12 
 
 		 660 aa  1104    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  51.04 
 
 		 666 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  69.5 
 
 		 654 aa  949    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  74.74 
 
 		 665 aa  1050    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  73.94 
 
 		 658 aa  1016    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  84.24 
 
 		 660 aa  1163    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  73.11 
 
 		 660 aa  984    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  52.31 
 
 		 647 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  56.1 
 
 		 658 aa  745    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.35 
 
 		 656 aa  693    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  76.42 
 
 		 633 aa  1026    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  51.84 
 
 		 645 aa  643    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  80.73 
 
 		 660 aa  1123    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  56.69 
 
 		 652 aa  717    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.75 
 
 		 655 aa  661    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.19 
 
 		 660 aa  698    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  51.45 
 
 		 657 aa  679    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 664 aa  1363    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  99.24 
 
 		 660 aa  1339    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  51.04 
 
 		 660 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  52.62 
 
 		 644 aa  649    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  90.7 
 
 		 660 aa  1238    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  51.35 
 
 		 660 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.96 
 
 		 655 aa  697    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  52.46 
 
 		 650 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  52.46 
 
 		 650 aa  650    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  95.27 
 
 		 660 aa  1252    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  51.23 
 
 		 650 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  94.69 
 
 		 660 aa  1274    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  95.58 
 
 		 660 aa  1293    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  93.22 
 
 		 664 aa  1274    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 		 650 aa  646    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2558  acetyl-CoA synthetase  50.84 
 
 		 650 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  86.04 
 
 		 660 aa  1183    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  50.82 
 
 		 676 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  99.24 
 
 		 660 aa  1339    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 664 aa  1363    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 		 661 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  71.56 
 
 		 664 aa  995    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  84.09 
 
 		 660 aa  1164    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  74.4 
 
 		 664 aa  1039    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  99.7 
 
 		 664 aa  1358    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  52.61 
 
 		 650 aa  651    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  52.34 
 
 		 657 aa  645    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.07 
 
 		 667 aa  667    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  52.46 
 
 		 650 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  73.78 
 
 		 666 aa  1018    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.69 
 
 		 658 aa  739    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  90.7 
 
 		 660 aa  1238    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  51 
 
 		 650 aa  648    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  51.04 
 
 		 660 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  51.41 
 
 		 649 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.27 
 
 		 660 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  90.7 
 
 		 660 aa  1238    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>