More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1067 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  51.93 
 
 
644 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  72.64 
 
 
660 aa  971    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  71.05 
 
 
658 aa  976    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  49.92 
 
 
660 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  76.86 
 
 
660 aa  1072    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  76.1 
 
 
660 aa  1065    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  74.55 
 
 
664 aa  1042    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  52.61 
 
 
657 aa  693    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 
660 aa  1036    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1451  acetyl-CoA synthetase  53.15 
 
 
647 aa  640    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 
660 aa  1035    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 
660 aa  1036    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  74.66 
 
 
680 aa  1021    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 
665 aa  1375    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  72.16 
 
 
654 aa  978    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.65 
 
 
664 aa  682    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.32 
 
 
658 aa  724    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  75.76 
 
 
660 aa  1071    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  67.68 
 
 
655 aa  905    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 
660 aa  1036    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  53.16 
 
 
657 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 
660 aa  1036    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  59.67 
 
 
657 aa  786    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  72.81 
 
 
658 aa  1010    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  74.1 
 
 
664 aa  1033    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  75.45 
 
 
660 aa  1033    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 
660 aa  1039    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.6 
 
 
667 aa  638    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  55.04 
 
 
673 aa  732    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
666 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  54.59 
 
 
657 aa  711    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.04 
 
 
661 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  62.78 
 
 
653 aa  834    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  53.59 
 
 
651 aa  716    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  50.53 
 
 
660 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.81 
 
 
656 aa  744    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  53.65 
 
 
646 aa  641    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 
660 aa  1036    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  83.46 
 
 
664 aa  1186    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1381  acetyl-CoA synthetase  52.84 
 
 
647 aa  641    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.319364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03257  acetyl-CoA synthetase  54.06 
 
 
647 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  51.57 
 
 
667 aa  647    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 
660 aa  1036    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  50.37 
 
 
660 aa  641    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  83.43 
 
 
665 aa  1187    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  51.97 
 
 
652 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  49.85 
 
 
664 aa  643    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  67.22 
 
 
654 aa  909    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  82.23 
 
 
665 aa  1156    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  71.45 
 
 
658 aa  976    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  73.9 
 
 
660 aa  1031    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  55.39 
 
 
655 aa  732    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  52.13 
 
 
649 aa  657    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  75.27 
 
 
660 aa  1049    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  52.66 
 
 
656 aa  706    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 
660 aa  1036    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  50.75 
 
 
670 aa  635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  76.21 
 
 
660 aa  1078    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.74 
 
 
652 aa  715    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.87 
 
 
655 aa  665    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  74.09 
 
 
633 aa  1004    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  73.82 
 
 
657 aa  1036    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  74.25 
 
 
664 aa  1035    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  74.92 
 
 
660 aa  1037    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  53.32 
 
 
655 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  54.9 
 
 
657 aa  717    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  49.92 
 
 
660 aa  670    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  74.52 
 
 
634 aa  993    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  52.76 
 
 
657 aa  695    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  52.8 
 
 
655 aa  698    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  75.53 
 
 
660 aa  1019    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  55.39 
 
 
655 aa  732    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  51.07 
 
 
645 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 
649 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  54.24 
 
 
651 aa  642    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  75.53 
 
 
660 aa  1046    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  74.4 
 
 
664 aa  1039    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  52.75 
 
 
643 aa  677    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  52.45 
 
 
657 aa  686    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  54.77 
 
 
658 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  71.05 
 
 
654 aa  984    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  74.92 
 
 
660 aa  1037    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  74.25 
 
 
664 aa  1035    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.17 
 
 
658 aa  718    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 
650 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  49.09 
 
 
660 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  51.47 
 
 
644 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  50.61 
 
 
657 aa  657    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  73.29 
 
 
660 aa  1028    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.99 
 
 
667 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  54.37 
 
 
658 aa  732    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0297  acetyl-CoA synthetase  53.69 
 
 
652 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.447688  hitchhiker  0.000249841 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.05 
 
 
645 aa  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  52.23 
 
 
650 aa  656    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  84.49 
 
 
666 aa  1190    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  50.38 
 
 
649 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 
660 aa  1036    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  51 
 
 
667 aa  640    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.1 
 
 
661 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  87.52 
 
 
664 aa  1224    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>