More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1451 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  64.81 
 
 
651 aa  869    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  61.47 
 
 
652 aa  829    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  61.31 
 
 
652 aa  827    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  62.52 
 
 
652 aa  843    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  64.63 
 
 
653 aa  862    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  60.75 
 
 
644 aa  828    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  60.84 
 
 
662 aa  808    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  63.65 
 
 
651 aa  858    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  59.26 
 
 
648 aa  807    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  60.75 
 
 
644 aa  826    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  64.4 
 
 
651 aa  866    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  62.83 
 
 
650 aa  846    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  64.12 
 
 
651 aa  858    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  61.28 
 
 
649 aa  838    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  53.93 
 
 
652 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0126  hypothetical protein  53.93 
 
 
652 aa  664    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  60.96 
 
 
653 aa  814    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  63.65 
 
 
651 aa  854    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0184  acetyl-CoA synthetase  60 
 
 
653 aa  794    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  61.09 
 
 
652 aa  828    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  62.21 
 
 
650 aa  841    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  52.47 
 
 
658 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  52.69 
 
 
660 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  54.31 
 
 
655 aa  665    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  65.48 
 
 
652 aa  891    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  53.59 
 
 
657 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  67.55 
 
 
650 aa  907    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  52.85 
 
 
657 aa  651    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  63.49 
 
 
651 aa  851    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  60 
 
 
645 aa  807    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  60.81 
 
 
653 aa  813    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  61.46 
 
 
651 aa  824    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  62.73 
 
 
650 aa  838    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  53.19 
 
 
673 aa  657    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  48.58 
 
 
666 aa  635    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  53.43 
 
 
657 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  54.08 
 
 
661 aa  700    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  52.73 
 
 
653 aa  677    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  63.34 
 
 
653 aa  856    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  51.75 
 
 
660 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  53.06 
 
 
656 aa  658    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  68.12 
 
 
646 aa  903    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  51.88 
 
 
644 aa  669    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  53.58 
 
 
636 aa  694    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  66.77 
 
 
652 aa  901    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  63.81 
 
 
649 aa  870    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  61.13 
 
 
645 aa  821    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  62.24 
 
 
645 aa  830    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  60.25 
 
 
645 aa  817    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  65.37 
 
 
647 aa  886    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  52.96 
 
 
654 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  66.04 
 
 
644 aa  903    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0624  acetyl-CoA synthetase  60.44 
 
 
651 aa  830    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  64.13 
 
 
649 aa  841    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  61.21 
 
 
651 aa  834    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.5 
 
 
656 aa  664    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  66.77 
 
 
650 aa  897    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  64.12 
 
 
649 aa  884    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  64.41 
 
 
652 aa  879    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  59.38 
 
 
655 aa  807    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  64.4 
 
 
651 aa  867    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  51.9 
 
 
652 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.45 
 
 
655 aa  664    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  61.24 
 
 
652 aa  798    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  61.59 
 
 
654 aa  810    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  62.21 
 
 
650 aa  843    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  64.63 
 
 
653 aa  862    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  50.96 
 
 
660 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.29 
 
 
644 aa  707    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  61.74 
 
 
646 aa  840    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  64.04 
 
 
654 aa  872    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  55.09 
 
 
631 aa  695    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.07 
 
 
655 aa  681    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  62.83 
 
 
650 aa  845    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  62.83 
 
 
650 aa  845    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  61.51 
 
 
645 aa  840    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  62.27 
 
 
650 aa  838    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  63.14 
 
 
651 aa  852    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3006  acetate--CoA ligase  61.44 
 
 
652 aa  820    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.972893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  62.23 
 
 
645 aa  858    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  63.49 
 
 
651 aa  857    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  63.35 
 
 
645 aa  836    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  60.5 
 
 
653 aa  813    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  60.84 
 
 
652 aa  826    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  53.15 
 
 
665 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  62.93 
 
 
650 aa  860    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  61.67 
 
 
645 aa  844    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  62.15 
 
 
644 aa  838    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  62.83 
 
 
650 aa  845    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  63.03 
 
 
645 aa  832    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  66.2 
 
 
647 aa  899    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  61.42 
 
 
651 aa  806    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  61.42 
 
 
651 aa  806    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  52.47 
 
 
658 aa  662    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  62.21 
 
 
650 aa  841    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  63.51 
 
 
650 aa  866    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  53.83 
 
 
658 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  63.34 
 
 
649 aa  860    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  52.26 
 
 
649 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  64.19 
 
 
649 aa  880    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>