More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3006 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3553  acetyl-coenzyme A synthetase  59.01 
 
 
658 aa  788    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  64.4 
 
 
652 aa  839    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  64.24 
 
 
652 aa  837    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  61.97 
 
 
653 aa  817    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  60.09 
 
 
644 aa  802    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  59.13 
 
 
662 aa  788    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  62.92 
 
 
650 aa  839    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  60.06 
 
 
648 aa  793    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  61.08 
 
 
653 aa  824    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  63.47 
 
 
651 aa  828    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  62.31 
 
 
650 aa  833    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  61.91 
 
 
651 aa  815    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  62.56 
 
 
650 aa  813    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  52.9 
 
 
652 aa  654    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0126  hypothetical protein  51.73 
 
 
652 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1863  acetyl-CoA synthetase  62.46 
 
 
650 aa  835    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.579141  normal  0.108064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  61.13 
 
 
651 aa  806    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0184  acetyl-CoA synthetase  57.48 
 
 
653 aa  730    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  61.38 
 
 
653 aa  827    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  51.33 
 
 
644 aa  649    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1399  acetate--CoA ligase  59.16 
 
 
653 aa  783    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570682  normal  0.412853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  64.38 
 
 
649 aa  834    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  64.84 
 
 
652 aa  862    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  60.03 
 
 
652 aa  803    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3992  acetyl-CoA synthetase  62.13 
 
 
653 aa  817    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733733  normal  0.105895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  59.6 
 
 
645 aa  800    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  64.4 
 
 
652 aa  839    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  62.54 
 
 
651 aa  819    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  59 
 
 
645 aa  777    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  61.08 
 
 
653 aa  823    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  63.42 
 
 
652 aa  838    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  63.88 
 
 
651 aa  829    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  53.02 
 
 
673 aa  636    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  63.81 
 
 
647 aa  838    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  52.6 
 
 
657 aa  640    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  57.52 
 
 
661 aa  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.35 
 
 
653 aa  660    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  62.6 
 
 
651 aa  826    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  64.4 
 
 
652 aa  839    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  52.87 
 
 
656 aa  653    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  62.32 
 
 
646 aa  806    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  63.47 
 
 
651 aa  828    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  61.82 
 
 
653 aa  820    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  61.68 
 
 
652 aa  824    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  62.6 
 
 
649 aa  848    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  61.84 
 
 
652 aa  819    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  60.13 
 
 
645 aa  786    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  62.34 
 
 
644 aa  822    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  62.09 
 
 
645 aa  816    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  60.65 
 
 
647 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  55.32 
 
 
654 aa  725    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00169  acetyl-CoA synthetase  64.04 
 
 
682 aa  832    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  62.46 
 
 
650 aa  828    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  63.71 
 
 
651 aa  841    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  62.58 
 
 
651 aa  842    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  60.09 
 
 
644 aa  801    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  61.37 
 
 
650 aa  816    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  63.61 
 
 
649 aa  844    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  59.72 
 
 
652 aa  795    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  57.17 
 
 
655 aa  748    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0624  acetyl-CoA synthetase  59.59 
 
 
651 aa  786    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  51.84 
 
 
656 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  65.15 
 
 
652 aa  864    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  60.96 
 
 
652 aa  783    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  58.23 
 
 
654 aa  744    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2562  acetyl-CoA synthetase  62.26 
 
 
649 aa  825    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.732738  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  60.09 
 
 
645 aa  796    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  64.44 
 
 
649 aa  820    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01635  acetyl-CoA synthase  58.29 
 
 
653 aa  794    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  67.24 
 
 
646 aa  888    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  64.22 
 
 
654 aa  835    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  51.67 
 
 
631 aa  644    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.39 
 
 
655 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  62.77 
 
 
650 aa  838    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  62.77 
 
 
650 aa  838    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  59.62 
 
 
645 aa  793    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  63.08 
 
 
650 aa  840    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  62.56 
 
 
651 aa  804    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  61.97 
 
 
653 aa  817    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  62.15 
 
 
650 aa  831    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  62.44 
 
 
651 aa  825    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  59.78 
 
 
645 aa  792    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3006  acetate--CoA ligase  100 
 
 
652 aa  1353    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.972893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  59.04 
 
 
651 aa  770    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  50.15 
 
 
649 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  61.99 
 
 
650 aa  831    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  62.46 
 
 
650 aa  830    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  58.36 
 
 
644 aa  775    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  62.77 
 
 
650 aa  838    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  50.95 
 
 
636 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0297  acetyl-CoA synthetase  63.45 
 
 
652 aa  845    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.447688  hitchhiker  0.000249841 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  60.82 
 
 
651 aa  795    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  60.82 
 
 
651 aa  795    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  58.06 
 
 
645 aa  773    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  63.38 
 
 
650 aa  839    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  60.09 
 
 
645 aa  794    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  64.51 
 
 
649 aa  863    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  62.46 
 
 
650 aa  830    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  64.95 
 
 
649 aa  860    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  56.64 
 
 
661 aa  714    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>