More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1863 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  89.08 
 
 		 650 aa  1226    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  67.44 
 
 		 652 aa  944    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  67.29 
 
 		 652 aa  942    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  72.52 
 
 		 653 aa  1006    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  59.97 
 
 		 644 aa  839    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  62.38 
 
 		 662 aa  856    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  64.34 
 
 		 649 aa  873    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  62.07 
 
 		 648 aa  838    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  61.94 
 
 		 645 aa  839    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  64.15 
 
 		 651 aa  883    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  88.31 
 
 		 650 aa  1216    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  69.95 
 
 		 651 aa  979    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  59.97 
 
 		 644 aa  838    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  54.96 
 
 		 652 aa  681    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0126  hypothetical protein  54.15 
 
 		 652 aa  676    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  52.48 
 
 		 658 aa  668    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  70.19 
 
 		 651 aa  978    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0184  acetyl-CoA synthetase  57.92 
 
 		 653 aa  768    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  52 
 
 		 658 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  60.75 
 
 		 651 aa  825    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  52.48 
 
 		 658 aa  670    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  51.1 
 
 		 660 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  54.75 
 
 		 655 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  63.27 
 
 		 652 aa  880    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  52.45 
 
 		 657 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  50.69 
 
 		 656 aa  655    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  52.07 
 
 		 657 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  69.57 
 
 		 651 aa  966    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  60.53 
 
 		 645 aa  829    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  61.69 
 
 		 653 aa  847    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0624  acetyl-CoA synthetase  58.88 
 
 		 651 aa  800    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.17 
 
 		 667 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  53.16 
 
 		 673 aa  684    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.71 
 
 		 666 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  52 
 
 		 657 aa  650    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  57.84 
 
 		 661 aa  739    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  50.39 
 
 		 653 aa  662    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  50.46 
 
 		 651 aa  637    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  50.99 
 
 		 660 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  53.78 
 
 		 656 aa  694    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  67.75 
 
 		 646 aa  916    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  72.52 
 
 		 653 aa  1006    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  64.09 
 
 		 652 aa  884    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  64.91 
 
 		 649 aa  904    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  61.43 
 
 		 645 aa  850    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  62.2 
 
 		 645 aa  832    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  50.38 
 
 		 660 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  63.48 
 
 		 645 aa  857    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  64.86 
 
 		 647 aa  894    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  53.43 
 
 		 654 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  64.66 
 
 		 650 aa  878    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  61.96 
 
 		 645 aa  840    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  52.29 
 
 		 644 aa  675    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  80.92 
 
 		 651 aa  1115    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  52.35 
 
 		 649 aa  722    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  64.71 
 
 		 650 aa  887    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  67.29 
 
 		 649 aa  931    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  61.88 
 
 		 652 aa  863    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  58.23 
 
 		 655 aa  788    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 		 660 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  51.64 
 
 		 652 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  53.24 
 
 		 655 aa  656    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  62.31 
 
 		 652 aa  831    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  59.57 
 
 		 654 aa  786    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  67.75 
 
 		 652 aa  949    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  50.16 
 
 		 636 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  69.61 
 
 		 649 aa  973    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  54.3 
 
 		 644 aa  684    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  63.16 
 
 		 646 aa  872    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  64.46 
 
 		 654 aa  885    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  51.99 
 
 		 631 aa  666    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  52.77 
 
 		 655 aa  679    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  88.92 
 
 		 650 aa  1223    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  89.08 
 
 		 650 aa  1224    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  63.23 
 
 		 645 aa  856    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  88 
 
 		 650 aa  1207    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  66.1 
 
 		 651 aa  891    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  51.65 
 
 		 660 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  67.03 
 
 		 644 aa  902    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  70.34 
 
 		 651 aa  985    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  62.1 
 
 		 645 aa  847    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  64.15 
 
 		 651 aa  883    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  70.96 
 
 		 653 aa  991    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  64.64 
 
 		 650 aa  889    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  61.71 
 
 		 644 aa  829    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  89.08 
 
 		 650 aa  1224    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  61.69 
 
 		 653 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.48 
 
 		 667 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  61.91 
 
 		 651 aa  822    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  61.82 
 
 		 651 aa  823    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  50.69 
 
 		 660 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  84.15 
 
 		 650 aa  1162    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3006  acetate--CoA ligase  62.46 
 
 		 652 aa  835    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.972893 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  68.26 
 
 		 649 aa  960    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  61.35 
 
 		 653 aa  852    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  70.74 
 
 		 649 aa  990    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  57.61 
 
 		 661 aa  720    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  50.31 
 
 		 660 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  88.92 
 
 		 650 aa  1215    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  92.62 
 
 		 650 aa  1274    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>