More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_44757 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2562  acetyl-CoA synthetase  55.16 
 
 
649 aa  723    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.732738  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  52.14 
 
 
652 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  52.14 
 
 
652 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  52.85 
 
 
653 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  54.44 
 
 
644 aa  678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  54.99 
 
 
662 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  53.12 
 
 
653 aa  681    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  53.72 
 
 
648 aa  685    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01635  acetyl-CoA synthase  51.66 
 
 
653 aa  655    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  54.73 
 
 
651 aa  694    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
650 aa  668    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  52.84 
 
 
651 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  52.69 
 
 
650 aa  672    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2725  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 
650 aa  673    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.469585  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3776  acetyl-CoA synthetase  53.27 
 
 
653 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.800941  hitchhiker  0.000764225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0297  acetyl-CoA synthetase  53.85 
 
 
652 aa  679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.447688  hitchhiker  0.000249841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  52.53 
 
 
651 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  53.8 
 
 
652 aa  687    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3006  acetate--CoA ligase  51.33 
 
 
652 aa  649    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.972893 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  52.14 
 
 
652 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3958  acetyl-CoA synthetase  52.14 
 
 
652 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00169  acetyl-CoA synthetase  53.47 
 
 
682 aa  682    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  53.71 
 
 
652 aa  700    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  55.05 
 
 
651 aa  698    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  56.22 
 
 
653 aa  703    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  53.69 
 
 
651 aa  658    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  52.92 
 
 
651 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  54.5 
 
 
645 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  56.22 
 
 
653 aa  703    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  100 
 
 
644 aa  1342    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  53.64 
 
 
652 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  55.29 
 
 
647 aa  693    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  52.14 
 
 
650 aa  668    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  50.08 
 
 
661 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3992  acetyl-CoA synthetase  52.69 
 
 
653 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733733  normal  0.105895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  54.73 
 
 
650 aa  703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1863  acetyl-CoA synthetase  52.29 
 
 
650 aa  675    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.579141  normal  0.108064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  53.71 
 
 
651 aa  698    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  54.84 
 
 
646 aa  709    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  52.14 
 
 
652 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  52.69 
 
 
650 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  54.89 
 
 
652 aa  692    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  54.02 
 
 
649 aa  690    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  53.88 
 
 
654 aa  691    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  53.53 
 
 
645 aa  671    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0111  acetyl-CoA synthetase  53.83 
 
 
646 aa  663    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865041  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  55.97 
 
 
645 aa  720    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  54.42 
 
 
647 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1399  acetate--CoA ligase  55.28 
 
 
653 aa  693    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570682  normal  0.412853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  55.87 
 
 
644 aa  716    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
650 aa  670    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  51.81 
 
 
651 aa  668    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  54.19 
 
 
645 aa  669    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  55.21 
 
 
650 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  53.64 
 
 
649 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  54.34 
 
 
652 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0731  acetyl-CoA synthetase  54.57 
 
 
644 aa  688    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40572  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  51.34 
 
 
650 aa  661    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3553  acetyl-coenzyme A synthetase  55.28 
 
 
658 aa  694    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  50.79 
 
 
655 aa  638    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  54.71 
 
 
652 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  52.02 
 
 
654 aa  641    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  53.16 
 
 
652 aa  680    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2952  acetyl-CoA synthetase  54.82 
 
 
649 aa  702    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  54.84 
 
 
649 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4701  acetyl-CoA synthetase  54.04 
 
 
644 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120403  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  51.82 
 
 
646 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  55.54 
 
 
654 aa  708    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5598  acetyl-CoA synthetase  54.5 
 
 
648 aa  706    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438623  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  53.64 
 
 
652 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  52.22 
 
 
650 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
650 aa  668    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  55.42 
 
 
645 aa  723    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  51.66 
 
 
650 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  54.91 
 
 
651 aa  684    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2558  acetyl-CoA synthetase  51.82 
 
 
650 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14601  predicted protein  52.72 
 
 
651 aa  659    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0178596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  53.38 
 
 
651 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  56.58 
 
 
645 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  53.08 
 
 
649 aa  678    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  54.7 
 
 
645 aa  702    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  55.78 
 
 
645 aa  708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  56.1 
 
 
650 aa  712    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  55.91 
 
 
653 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  56.12 
 
 
644 aa  722    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  52.22 
 
 
650 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  54.44 
 
 
644 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4531  acetyl-CoA synthetase  52.3 
 
 
652 aa  669    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  54.8 
 
 
651 aa  682    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  54.8 
 
 
651 aa  682    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  53.22 
 
 
651 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  49.76 
 
 
649 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  52.69 
 
 
650 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  56.89 
 
 
645 aa  719    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  54.66 
 
 
649 aa  696    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  52.85 
 
 
653 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  54.15 
 
 
649 aa  707    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1451  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 
647 aa  669    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  54.73 
 
 
651 aa  695    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  52.85 
 
 
652 aa  672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>