More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3109 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  65.67 
 
 		 645 aa  891    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  69.05 
 
 		 652 aa  952    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  68.9 
 
 		 652 aa  950    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  88.06 
 
 		 653 aa  1219    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  64.56 
 
 		 644 aa  863    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  62.05 
 
 		 662 aa  833    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  66.97 
 
 		 651 aa  914    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  63.03 
 
 		 648 aa  843    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  51.56 
 
 		 660 aa  644    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  66.97 
 
 		 651 aa  915    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  70.81 
 
 		 650 aa  997    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  86.79 
 
 		 651 aa  1205    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  52.32 
 
 		 636 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  55.5 
 
 		 652 aa  684    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0126  hypothetical protein  55.17 
 
 		 652 aa  682    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  51.84 
 
 		 658 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  86.94 
 
 		 651 aa  1207    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0184  acetyl-CoA synthetase  59.51 
 
 		 653 aa  796    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 		 654 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  53.39 
 
 		 656 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  51.84 
 
 		 658 aa  655    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  52.38 
 
 		 660 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  53.76 
 
 		 655 aa  667    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  64.44 
 
 		 652 aa  890    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  52.03 
 
 		 657 aa  646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  67.45 
 
 		 650 aa  899    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  54.28 
 
 		 657 aa  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  89.09 
 
 		 651 aa  1234    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  60.87 
 
 		 645 aa  818    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  62.92 
 
 		 653 aa  843    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  70.42 
 
 		 649 aa  992    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.58 
 
 		 667 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  53.51 
 
 		 673 aa  670    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.35 
 
 		 666 aa  651    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  52.89 
 
 		 657 aa  644    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  56.6 
 
 		 661 aa  727    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.01 
 
 		 653 aa  662    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  64.56 
 
 		 644 aa  863    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  51.23 
 
 		 660 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  52.41 
 
 		 656 aa  666    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  69.14 
 
 		 646 aa  919    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  50.92 
 
 		 660 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  62.33 
 
 		 645 aa  840    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  66.98 
 
 		 652 aa  909    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  67.59 
 
 		 649 aa  925    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  64.61 
 
 		 645 aa  852    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  55.28 
 
 		 649 aa  745    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  63.31 
 
 		 645 aa  859    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  66.51 
 
 		 647 aa  912    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  55.06 
 
 		 654 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  71.12 
 
 		 650 aa  992    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  50.31 
 
 		 660 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  51 
 
 		 660 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  68.17 
 
 		 651 aa  947    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  52.27 
 
 		 649 aa  639    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  66.82 
 
 		 650 aa  906    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  69.42 
 
 		 649 aa  942    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  64.44 
 
 		 652 aa  890    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  59.51 
 
 		 655 aa  810    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  66.67 
 
 		 644 aa  902    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.93 
 
 		 652 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  54.95 
 
 		 655 aa  671    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  64.8 
 
 		 652 aa  829    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  63.17 
 
 		 654 aa  814    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  88.06 
 
 		 653 aa  1219    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  62.96 
 
 		 653 aa  844    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  63.16 
 
 		 653 aa  846    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.08 
 
 		 644 aa  705    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  66.93 
 
 		 646 aa  911    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  65.04 
 
 		 654 aa  894    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  53.06 
 
 		 631 aa  672    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  52.15 
 
 		 655 aa  647    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  71.27 
 
 		 650 aa  1003    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  71.27 
 
 		 650 aa  1003    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  62.89 
 
 		 645 aa  847    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  69.57 
 
 		 650 aa  985    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  66.05 
 
 		 651 aa  888    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  64.39 
 
 		 651 aa  862    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  53.59 
 
 		 657 aa  651    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  90.78 
 
 		 651 aa  1253    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  63.69 
 
 		 645 aa  860    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  62.96 
 
 		 652 aa  868    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  70.5 
 
 		 650 aa  994    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  53.12 
 
 		 644 aa  681    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  66.56 
 
 		 650 aa  915    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  63.88 
 
 		 644 aa  870    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  71.27 
 
 		 650 aa  1003    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  52.43 
 
 		 657 aa  635    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  51.85 
 
 		 667 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  62.32 
 
 		 651 aa  811    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  62.32 
 
 		 651 aa  811    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  68.43 
 
 		 652 aa  949    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  69.41 
 
 		 650 aa  973    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 653 aa  1353    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  67.08 
 
 		 649 aa  938    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  52.41 
 
 		 658 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  70.7 
 
 		 649 aa  980    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  56.92 
 
 		 661 aa  719    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  62.58 
 
 		 645 aa  842    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  71.12 
 
 		 650 aa  1000    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>