More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2229 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  53.14 
 
 
652 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  52.99 
 
 
652 aa  666    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  52.06 
 
 
653 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  51.17 
 
 
650 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  78.64 
 
 
660 aa  1109    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  86.06 
 
 
660 aa  1207    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.17 
 
 
656 aa  728    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  52.38 
 
 
657 aa  698    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.04 
 
 
660 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  51.32 
 
 
650 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  52.36 
 
 
651 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  78.64 
 
 
660 aa  1109    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  52.69 
 
 
651 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  78.64 
 
 
660 aa  1109    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  74.34 
 
 
654 aa  1034    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  52.66 
 
 
656 aa  677    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  56.21 
 
 
658 aa  749    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
660 aa  1366    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  70.61 
 
 
655 aa  974    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  52.38 
 
 
653 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.24 
 
 
657 aa  735    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  78.64 
 
 
660 aa  1109    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  61.64 
 
 
657 aa  822    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  52.38 
 
 
651 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  53.16 
 
 
644 aa  653    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  51.62 
 
 
645 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  80 
 
 
660 aa  1119    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  51.75 
 
 
667 aa  665    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  58.48 
 
 
673 aa  787    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.82 
 
 
666 aa  680    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  57.12 
 
 
657 aa  752    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.94 
 
 
661 aa  697    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  62.9 
 
 
653 aa  837    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  55.21 
 
 
651 aa  722    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.34 
 
 
660 aa  700    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.78 
 
 
656 aa  742    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  52.29 
 
 
646 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  78.79 
 
 
660 aa  1108    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  75.76 
 
 
665 aa  1071    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  52.53 
 
 
657 aa  700    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  51.46 
 
 
652 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  53.35 
 
 
649 aa  643    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  58.12 
 
 
658 aa  770    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  75.53 
 
 
665 aa  1057    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  51.37 
 
 
645 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  53.02 
 
 
647 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  68.89 
 
 
654 aa  951    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  76.6 
 
 
665 aa  1073    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  73.29 
 
 
658 aa  1038    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  79.06 
 
 
660 aa  1118    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  50.84 
 
 
666 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  49.85 
 
 
649 aa  642    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  51.77 
 
 
650 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  51.83 
 
 
649 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  78.64 
 
 
660 aa  1109    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  78.64 
 
 
660 aa  1109    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  90.91 
 
 
660 aa  1255    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  56.67 
 
 
652 aa  747    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 
655 aa  670    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  78.64 
 
 
660 aa  1109    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.37 
 
 
645 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  79.36 
 
 
664 aa  1112    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  79.55 
 
 
660 aa  1115    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  50.84 
 
 
660 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53.7 
 
 
644 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  51.89 
 
 
660 aa  698    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  51.68 
 
 
649 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.49 
 
 
655 aa  732    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  51.48 
 
 
650 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  51.63 
 
 
650 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  52.14 
 
 
645 aa  658    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  50.38 
 
 
650 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  54.93 
 
 
651 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  80 
 
 
660 aa  1123    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  79.36 
 
 
664 aa  1114    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  50.61 
 
 
650 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  51.77 
 
 
645 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  50.67 
 
 
673 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  51.64 
 
 
676 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  79.55 
 
 
660 aa  1115    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  79.36 
 
 
664 aa  1112    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  76.83 
 
 
657 aa  1092    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  56.06 
 
 
658 aa  742    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  53.47 
 
 
650 aa  671    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  74.47 
 
 
664 aa  1044    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  51.91 
 
 
644 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  51.79 
 
 
650 aa  658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  52.67 
 
 
657 aa  656    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  51.37 
 
 
667 aa  671    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 
652 aa  653    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  51.63 
 
 
650 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  76.7 
 
 
633 aa  1031    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.12 
 
 
660 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 
650 aa  668    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  50.84 
 
 
660 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  50.53 
 
 
649 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  48.64 
 
 
715 aa  635    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  51.98 
 
 
649 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  51.88 
 
 
661 aa  652    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  75.61 
 
 
664 aa  1064    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>