More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2371 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  54.53 
 
 
652 aa  689    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  54.53 
 
 
652 aa  689    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  51.76 
 
 
652 aa  679    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  53.43 
 
 
653 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  55.77 
 
 
644 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  54.59 
 
 
662 aa  732    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  53.88 
 
 
660 aa  714    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  54.74 
 
 
648 aa  688    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  53.48 
 
 
657 aa  702    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  56.1 
 
 
651 aa  686    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  53.54 
 
 
650 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  53.11 
 
 
651 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  54.42 
 
 
660 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  53.43 
 
 
651 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  52.31 
 
 
654 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  53.79 
 
 
656 aa  706    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  68.15 
 
 
658 aa  956    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  54.49 
 
 
660 aa  732    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  56.51 
 
 
655 aa  748    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  54.24 
 
 
652 aa  694    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  82.34 
 
 
657 aa  1150    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  54.42 
 
 
660 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  56.36 
 
 
657 aa  769    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  53.27 
 
 
651 aa  658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  55.02 
 
 
645 aa  700    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  54.27 
 
 
660 aa  708    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  58.27 
 
 
667 aa  793    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  67.13 
 
 
673 aa  937    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  57.91 
 
 
666 aa  813    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  67.58 
 
 
657 aa  927    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  59.7 
 
 
661 aa  786    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  56.84 
 
 
653 aa  750    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  54.22 
 
 
651 aa  699    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  63.71 
 
 
660 aa  877    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  77.47 
 
 
656 aa  1087    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  54.46 
 
 
646 aa  685    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  53.96 
 
 
660 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  56.13 
 
 
631 aa  715    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  54.56 
 
 
652 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  52.17 
 
 
649 aa  668    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  56.79 
 
 
629 aa  693    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  53.26 
 
 
629 aa  678    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  52.74 
 
 
665 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  55.57 
 
 
645 aa  702    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  55.02 
 
 
647 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  56.51 
 
 
654 aa  754    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  53.73 
 
 
665 aa  707    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  51.9 
 
 
658 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  53.96 
 
 
660 aa  703    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  52.9 
 
 
651 aa  685    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  59.63 
 
 
649 aa  774    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  54.07 
 
 
629 aa  654    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  55.33 
 
 
650 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  55.37 
 
 
649 aa  714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  54.24 
 
 
652 aa  691    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  52.07 
 
 
655 aa  674    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  54.64 
 
 
660 aa  723    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  61.51 
 
 
652 aa  847    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  57.25 
 
 
655 aa  768    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  53.96 
 
 
664 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  53.66 
 
 
660 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  54.39 
 
 
660 aa  701    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  60.94 
 
 
644 aa  783    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  55.47 
 
 
654 aa  695    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
655 aa  1359    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  53.38 
 
 
650 aa  692    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  53.38 
 
 
650 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  56.66 
 
 
645 aa  724    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  53.38 
 
 
650 aa  685    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  54.46 
 
 
651 aa  667    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  54.57 
 
 
660 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  54.42 
 
 
664 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  52.47 
 
 
651 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  56.36 
 
 
645 aa  716    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  54.7 
 
 
673 aa  668    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  54.45 
 
 
676 aa  691    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  53.66 
 
 
660 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  53.96 
 
 
664 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  53.03 
 
 
659 aa  692    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  53.19 
 
 
670 aa  710    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  53.86 
 
 
660 aa  720    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  49.16 
 
 
656 aa  665    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  55.52 
 
 
650 aa  713    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  53.83 
 
 
656 aa  707    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  57.85 
 
 
644 aa  736    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  53.38 
 
 
650 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  55.11 
 
 
657 aa  713    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  57.82 
 
 
667 aa  811    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  55.16 
 
 
638 aa  710    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  55.56 
 
 
664 aa  716    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  54.46 
 
 
650 aa  699    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  51.48 
 
 
667 aa  662    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  54.39 
 
 
660 aa  701    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  53.31 
 
 
649 aa  689    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  54 
 
 
663 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  55.34 
 
 
649 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  56.36 
 
 
661 aa  737    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  51.74 
 
 
664 aa  685    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  53.73 
 
 
664 aa  713    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  52.8 
 
 
665 aa  698    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>