More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3063 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.45 
 
 		 645 aa  648    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  74.2 
 
 		 660 aa  1018    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  53.16 
 
 		 654 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  54.89 
 
 		 655 aa  709    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1033    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  53.36 
 
 		 647 aa  652    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  75.27 
 
 		 660 aa  1028    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  51.96 
 
 		 644 aa  640    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  53.67 
 
 		 657 aa  707    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  51.22 
 
 		 649 aa  649    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  76.04 
 
 		 664 aa  1031    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  76.31 
 
 		 660 aa  1033    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1033    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  53.52 
 
 		 657 aa  699    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  72.81 
 
 		 665 aa  1010    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  78.17 
 
 		 654 aa  1071    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  52.99 
 
 		 656 aa  666    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  55.28 
 
 		 658 aa  716    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  76.19 
 
 		 660 aa  1050    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  67.38 
 
 		 655 aa  901    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  50.91 
 
 		 666 aa  636    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  54.44 
 
 		 657 aa  685    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1033    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  60.06 
 
 		 657 aa  805    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  77.6 
 
 		 660 aa  1016    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 		 657 aa  638    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2526  acetate/CoA ligase  71.08 
 
 		 666 aa  983    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  76.46 
 
 		 660 aa  1039    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  55.37 
 
 		 658 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.57 
 
 		 673 aa  727    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.91 
 
 		 656 aa  683    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.28 
 
 		 657 aa  705    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.46 
 
 		 661 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  62 
 
 		 653 aa  820    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  55.5 
 
 		 651 aa  717    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.45 
 
 		 660 aa  693    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.13 
 
 		 656 aa  709    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  52.62 
 
 		 646 aa  643    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  74.62 
 
 		 660 aa  1027    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.98 
 
 		 658 aa  707    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1033    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3974  acetyl-CoA synthetase  53.16 
 
 		 647 aa  649    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162382  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0983  acetate/CoA ligase  72.81 
 
 		 665 aa  1010    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  100 
 
 		 658 aa  1357    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  72.85 
 
 		 665 aa  1012    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  73.89 
 
 		 660 aa  1020    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  73.03 
 
 		 658 aa  987    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  65.34 
 
 		 654 aa  875    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  73.08 
 
 		 665 aa  1022    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  70.8 
 
 		 658 aa  964    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  74.35 
 
 		 660 aa  1022    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  55.44 
 
 		 658 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5367  acetate/CoA ligase  80.64 
 
 		 655 aa  1098    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657438  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  75.38 
 
 		 660 aa  1033    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  49.54 
 
 		 664 aa  641    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  76.19 
 
 		 664 aa  1042    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  52.99 
 
 		 660 aa  692    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  77.11 
 
 		 660 aa  1054    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.67 
 
 		 652 aa  684    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  54.17 
 
 		 655 aa  671    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  53.83 
 
 		 657 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  74.43 
 
 		 657 aa  1038    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  76.04 
 
 		 664 aa  1031    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  76 
 
 		 660 aa  1029    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  50.91 
 
 		 660 aa  636    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53.27 
 
 		 644 aa  655    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1033    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  53.45 
 
 		 667 aa  635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.37 
 
 		 655 aa  675    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  76.34 
 
 		 660 aa  1022    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  72.46 
 
 		 666 aa  993    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 		 645 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  53.53 
 
 		 664 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  51.68 
 
 		 660 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  76.15 
 
 		 660 aa  1041    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  76.04 
 
 		 664 aa  1040    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  84.47 
 
 		 633 aa  1119    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  54.89 
 
 		 655 aa  709    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  76.04 
 
 		 680 aa  1018    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  53.08 
 
 		 676 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  76 
 
 		 660 aa  1029    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  76.04 
 
 		 664 aa  1031    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  54.06 
 
 		 655 aa  690    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  50.92 
 
 		 643 aa  646    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  53.82 
 
 		 657 aa  709    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  52.85 
 
 		 644 aa  642    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  77.69 
 
 		 654 aa  1068    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  54.7 
 
 		 657 aa  648    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  74.81 
 
 		 660 aa  1030    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1033    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.14 
 
 		 660 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  72.46 
 
 		 664 aa  989    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1033    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  54.23 
 
 		 670 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  50.91 
 
 		 660 aa  636    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  54.62 
 
 		 667 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03257  acetyl-CoA synthetase  52.39 
 
 		 647 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  51.14 
 
 		 661 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  76.52 
 
 		 634 aa  1005    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  74.35 
 
 		 664 aa  1017    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>