More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5367 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  73.47 
 
 		 664 aa  981    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  75.19 
 
 		 654 aa  1024    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  76.98 
 
 		 660 aa  1026    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2562  acetyl-CoA synthetase  51.63 
 
 		 649 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.732738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2526  acetate/CoA ligase  74.29 
 
 		 666 aa  987    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  53.88 
 
 		 645 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  76.83 
 
 		 660 aa  1030    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  51.7 
 
 		 664 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  53.68 
 
 		 657 aa  681    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  76.24 
 
 		 664 aa  1025    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6251  acetate/CoA ligase  73.98 
 
 		 664 aa  984    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42750  acetyl-CoA synthetase  52.86 
 
 		 645 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.74253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  75.27 
 
 		 660 aa  1012    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  74.29 
 
 		 634 aa  985    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  53.83 
 
 		 657 aa  683    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  76.23 
 
 		 654 aa  1031    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  53.28 
 
 		 656 aa  643    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.44 
 
 		 658 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  76.21 
 
 		 660 aa  1033    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  68.75 
 
 		 655 aa  892    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2785  acetyl-CoA synthetase  51.87 
 
 		 652 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.301549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  53.89 
 
 		 657 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  75.27 
 
 		 660 aa  1012    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  58.7 
 
 		 657 aa  760    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2494  acetyl-CoA synthetase  52.69 
 
 		 649 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3974  acetyl-CoA synthetase  53.79 
 
 		 647 aa  651    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162382  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  51.55 
 
 		 664 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  76.98 
 
 		 660 aa  1027    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  76.26 
 
 		 660 aa  1020    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  55.28 
 
 		 673 aa  689    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0983  acetate/CoA ligase  73.26 
 
 		 665 aa  1001    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  54.19 
 
 		 657 aa  669    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.56 
 
 		 661 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  62 
 
 		 653 aa  801    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  54.06 
 
 		 651 aa  684    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.81 
 
 		 660 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.8 
 
 		 656 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  53.99 
 
 		 646 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  74.96 
 
 		 660 aa  1008    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.29 
 
 		 658 aa  675    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  77.67 
 
 		 660 aa  1006    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  55.02 
 
 		 655 aa  686    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  75.27 
 
 		 660 aa  1012    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  77.29 
 
 		 680 aa  1017    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  72.77 
 
 		 665 aa  970    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  74.01 
 
 		 658 aa  1013    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  52.01 
 
 		 646 aa  641    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  65.98 
 
 		 654 aa  869    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  74.11 
 
 		 665 aa  1001    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  71.69 
 
 		 658 aa  998    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  75 
 
 		 660 aa  1011    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  54.18 
 
 		 647 aa  651    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  75.27 
 
 		 660 aa  1012    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  76.64 
 
 		 664 aa  1020    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  55.02 
 
 		 655 aa  686    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2833  acetyl-CoA synthetase  50.46 
 
 		 649 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  54.73 
 
 		 658 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  76.83 
 
 		 660 aa  1031    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.36 
 
 		 652 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.41 
 
 		 655 aa  644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  75.24 
 
 		 660 aa  1012    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  75.27 
 
 		 660 aa  1012    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  76.95 
 
 		 664 aa  1024    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  76.83 
 
 		 660 aa  1025    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  55.28 
 
 		 658 aa  656    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  54 
 
 		 644 aa  635    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  54.7 
 
 		 645 aa  663    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  53.49 
 
 		 655 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  53.56 
 
 		 660 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  51.55 
 
 		 655 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  54.11 
 
 		 658 aa  695    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  76.65 
 
 		 660 aa  1024    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  54.28 
 
 		 645 aa  657    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  53.38 
 
 		 657 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  75.27 
 
 		 660 aa  1012    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  76.52 
 
 		 660 aa  1025    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  76.09 
 
 		 664 aa  1022    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  53.81 
 
 		 667 aa  644    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  53.17 
 
 		 645 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  85.15 
 
 		 633 aa  1125    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  73.02 
 
 		 666 aa  977    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  76.83 
 
 		 660 aa  1025    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  76.95 
 
 		 664 aa  1024    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  52.89 
 
 		 656 aa  665    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5367  acetate/CoA ligase  100 
 
 		 655 aa  1348    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  52.49 
 
 		 649 aa  639    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  77.45 
 
 		 660 aa  1021    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  53.14 
 
 		 663 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  53.45 
 
 		 657 aa  672    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  75.27 
 
 		 660 aa  1012    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.7 
 
 		 660 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  73.26 
 
 		 665 aa  999    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  52.46 
 
 		 660 aa  661    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 		 650 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  80.64 
 
 		 658 aa  1098    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  52.77 
 
 		 647 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  74.31 
 
 		 657 aa  1022    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  77.29 
 
 		 660 aa  1035    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  77.29 
 
 		 660 aa  1037    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  75.78 
 
 		 664 aa  1014    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>