More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0611 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  54.52 
 
 
664 aa  680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  52 
 
 
652 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 
652 aa  639    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  55.4 
 
 
658 aa  725    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  69.58 
 
 
715 aa  922    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  54.39 
 
 
660 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 
660 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  54.77 
 
 
660 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  49.46 
 
 
657 aa  639    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  51 
 
 
651 aa  638    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  54.77 
 
 
660 aa  677    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  59.16 
 
 
660 aa  738    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  54.77 
 
 
660 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  54.52 
 
 
680 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  70.27 
 
 
661 aa  918    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  52.23 
 
 
654 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  68.77 
 
 
656 aa  908    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  55.62 
 
 
658 aa  741    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 
660 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  56.79 
 
 
655 aa  719    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  57.62 
 
 
658 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  56.48 
 
 
657 aa  730    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  54.77 
 
 
660 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  56.62 
 
 
657 aa  727    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  58.08 
 
 
656 aa  738    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.64 
 
 
660 aa  718    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  54.31 
 
 
660 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  53.27 
 
 
667 aa  672    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.93 
 
 
673 aa  731    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  53.15 
 
 
666 aa  686    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  56.1 
 
 
657 aa  711    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.67 
 
 
660 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  54.19 
 
 
661 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  56.39 
 
 
653 aa  734    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  53.41 
 
 
664 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.59 
 
 
660 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.95 
 
 
656 aa  740    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  54.7 
 
 
660 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  54.16 
 
 
660 aa  673    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  52 
 
 
651 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  57.19 
 
 
667 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  73.99 
 
 
654 aa  965    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  52.11 
 
 
657 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  52.18 
 
 
665 aa  648    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  51.89 
 
 
664 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  51.82 
 
 
664 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  59.29 
 
 
673 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  51 
 
 
651 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  52.72 
 
 
651 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  54.43 
 
 
654 aa  716    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  52.46 
 
 
665 aa  656    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  55.48 
 
 
658 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  54.59 
 
 
660 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  53.11 
 
 
649 aa  694    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  51.31 
 
 
638 aa  643    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  55.82 
 
 
656 aa  723    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  52 
 
 
652 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  51.31 
 
 
655 aa  643    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  53.11 
 
 
660 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  58.95 
 
 
652 aa  728    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  57.54 
 
 
655 aa  734    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  53.41 
 
 
664 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  53.64 
 
 
660 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  67.86 
 
 
660 aa  879    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.94 
 
 
644 aa  696    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  49.61 
 
 
657 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  53.79 
 
 
660 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  55.32 
 
 
655 aa  716    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  54.77 
 
 
660 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  54.37 
 
 
633 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  53.7 
 
 
658 aa  659    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  54.77 
 
 
660 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  66.56 
 
 
653 aa  853    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  55.37 
 
 
660 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  54.37 
 
 
664 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  53.25 
 
 
666 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  66.25 
 
 
651 aa  829    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  53.23 
 
 
670 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  70.16 
 
 
673 aa  899    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  71.62 
 
 
676 aa  938    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  53.64 
 
 
660 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  53.41 
 
 
664 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  67.86 
 
 
666 aa  879    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  50 
 
 
670 aa  636    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  51.98 
 
 
634 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  53.08 
 
 
664 aa  668    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  55.22 
 
 
660 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  51.99 
 
 
656 aa  641    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  51.64 
 
 
644 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  54.77 
 
 
660 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  68.15 
 
 
657 aa  909    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  53.86 
 
 
667 aa  697    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.66 
 
 
661 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 
645 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  51.03 
 
 
638 aa  635    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  72.03 
 
 
664 aa  913    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.94 
 
 
660 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  55.5 
 
 
649 aa  701    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  67.86 
 
 
660 aa  879    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  55.02 
 
 
658 aa  732    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>