More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1708 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
660 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  52.71 
 
 
655 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.18 
 
 
658 aa  697    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 
667 aa  644    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  51.46 
 
 
664 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51 
 
 
662 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  52.7 
 
 
660 aa  698    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  52.86 
 
 
660 aa  701    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
657 aa  1359    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
651 aa  638    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.07 
 
 
656 aa  698    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  53.48 
 
 
658 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  52.43 
 
 
660 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  52.3 
 
 
666 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  53.28 
 
 
657 aa  708    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  54.28 
 
 
654 aa  720    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  50.38 
 
 
656 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.11 
 
 
658 aa  702    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  52.38 
 
 
660 aa  698    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.55 
 
 
655 aa  687    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  51.76 
 
 
664 aa  675    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  54.6 
 
 
657 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  52.43 
 
 
660 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.86 
 
 
657 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  52.53 
 
 
660 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  51.3 
 
 
664 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  97.11 
 
 
657 aa  1323    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  51.37 
 
 
660 aa  683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  51.01 
 
 
661 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  54.87 
 
 
673 aa  729    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  52.86 
 
 
660 aa  701    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  54.4 
 
 
657 aa  706    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  51.15 
 
 
661 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  52.53 
 
 
653 aa  696    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  66.15 
 
 
651 aa  929    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  55.81 
 
 
660 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  53.17 
 
 
656 aa  700    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5367  acetate/CoA ligase  53.68 
 
 
655 aa  681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657438  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 
660 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  52.43 
 
 
660 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  99.54 
 
 
657 aa  1352    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  51.09 
 
 
645 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  51.78 
 
 
660 aa  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  52.43 
 
 
660 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  56.11 
 
 
660 aa  729    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  54.87 
 
 
658 aa  727    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  53.46 
 
 
665 aa  691    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  51.22 
 
 
660 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  52.43 
 
 
660 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  53.1 
 
 
654 aa  697    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  53 
 
 
665 aa  696    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  52.64 
 
 
658 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  52.84 
 
 
660 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.71 
 
 
649 aa  648    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  48.32 
 
 
715 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  49.69 
 
 
680 aa  646    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
645 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  52.85 
 
 
660 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  52.23 
 
 
660 aa  698    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  51 
 
 
652 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  49.3 
 
 
667 aa  636    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  51.96 
 
 
647 aa  650    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  51.3 
 
 
664 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  51.06 
 
 
660 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  54.08 
 
 
634 aa  691    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2526  acetate/CoA ligase  51.83 
 
 
666 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  51.91 
 
 
643 aa  661    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.48 
 
 
655 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  55.62 
 
 
660 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  52.43 
 
 
660 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  54.24 
 
 
657 aa  700    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  51.6 
 
 
660 aa  678    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  51.22 
 
 
660 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  51.31 
 
 
664 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
651 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6251  acetate/CoA ligase  52.13 
 
 
664 aa  685    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  51.15 
 
 
680 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  50.7 
 
 
646 aa  659    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  51.06 
 
 
660 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  51.3 
 
 
664 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  52.61 
 
 
665 aa  693    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  53.67 
 
 
658 aa  707    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  50.86 
 
 
670 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  55.78 
 
 
660 aa  721    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
663 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  49.92 
 
 
654 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  50.77 
 
 
657 aa  640    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0983  acetate/CoA ligase  52.61 
 
 
665 aa  693    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  53.44 
 
 
654 aa  723    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  55.18 
 
 
664 aa  708    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  55.15 
 
 
655 aa  717    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  51.92 
 
 
660 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  54.96 
 
 
633 aa  691    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  50.39 
 
 
654 aa  636    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  51.71 
 
 
649 aa  649    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  52.43 
 
 
660 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  52.71 
 
 
655 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  52.91 
 
 
658 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  54.71 
 
 
664 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  52.83 
 
 
664 aa  694    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>