More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5594 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  73.71 
 
 
660 aa  1034    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  53.58 
 
 
655 aa  691    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  53.58 
 
 
655 aa  691    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  70.93 
 
 
664 aa  999    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  70.35 
 
 
666 aa  956    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  75 
 
 
660 aa  1036    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  52.16 
 
 
645 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  72.41 
 
 
660 aa  1019    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  74.16 
 
 
660 aa  1031    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  52.91 
 
 
657 aa  665    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  53.59 
 
 
664 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  73.7 
 
 
660 aa  1025    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  61.61 
 
 
650 aa  790    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  73.71 
 
 
660 aa  1034    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  53.96 
 
 
667 aa  647    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  53.07 
 
 
657 aa  668    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  71.59 
 
 
654 aa  985    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 
656 aa  636    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.05 
 
 
658 aa  706    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  74.92 
 
 
660 aa  1038    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  65.05 
 
 
655 aa  882    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  71.78 
 
 
660 aa  1021    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  52.96 
 
 
657 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  73.71 
 
 
660 aa  1034    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  58.66 
 
 
657 aa  765    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  53.52 
 
 
657 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  100 
 
 
658 aa  1349    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0983  acetate/CoA ligase  71.05 
 
 
665 aa  975    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  74.09 
 
 
660 aa  1035    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  49.85 
 
 
660 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  55.97 
 
 
673 aa  712    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  69.84 
 
 
657 aa  985    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.75 
 
 
657 aa  694    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  51.48 
 
 
661 aa  646    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  60.77 
 
 
653 aa  784    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  53.29 
 
 
651 aa  698    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  51.67 
 
 
660 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.03 
 
 
656 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2526  acetate/CoA ligase  69.56 
 
 
666 aa  946    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  73.56 
 
 
660 aa  1030    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  51.48 
 
 
656 aa  663    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  73.71 
 
 
660 aa  1034    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  53.64 
 
 
648 aa  647    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  71.05 
 
 
665 aa  976    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  52.06 
 
 
649 aa  640    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  69.17 
 
 
665 aa  947    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  73.71 
 
 
660 aa  1034    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  67.04 
 
 
654 aa  883    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  68.75 
 
 
665 aa  975    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  87.02 
 
 
658 aa  1195    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  72.16 
 
 
660 aa  1018    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.11 
 
 
658 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1868  acetate/CoA ligase  58.38 
 
 
652 aa  761    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.477544  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  50.76 
 
 
663 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  68.84 
 
 
660 aa  941    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6251  acetate/CoA ligase  69.24 
 
 
664 aa  944    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  72.64 
 
 
660 aa  1025    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  53.59 
 
 
652 aa  683    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.23 
 
 
655 aa  640    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  52.5 
 
 
660 aa  681    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  69.72 
 
 
664 aa  941    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 
664 aa  1029    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  74.01 
 
 
660 aa  1030    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  70.22 
 
 
634 aa  962    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  55.8 
 
 
658 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  75.27 
 
 
664 aa  1038    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  69.6 
 
 
664 aa  961    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  52.1 
 
 
655 aa  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  73.03 
 
 
658 aa  987    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  74.61 
 
 
664 aa  1027    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  52.67 
 
 
657 aa  662    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  51.21 
 
 
649 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  74.05 
 
 
660 aa  1034    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  75.27 
 
 
664 aa  1038    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  75.99 
 
 
660 aa  1018    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  53.9 
 
 
658 aa  701    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  50.95 
 
 
660 aa  635    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  74.01 
 
 
660 aa  1030    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 
664 aa  1029    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  75.9 
 
 
680 aa  1030    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  53.28 
 
 
664 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  73.85 
 
 
633 aa  1008    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  53.86 
 
 
658 aa  651    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  70.6 
 
 
654 aa  979    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  75.38 
 
 
660 aa  1031    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  73.71 
 
 
660 aa  1034    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5367  acetate/CoA ligase  74.01 
 
 
655 aa  1013    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657438  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  54.29 
 
 
648 aa  707    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.34 
 
 
660 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  73.71 
 
 
660 aa  1034    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  51.87 
 
 
655 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  53.75 
 
 
674 aa  648    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  50 
 
 
652 aa  642    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  75.16 
 
 
660 aa  1040    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  51.44 
 
 
643 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  53.35 
 
 
680 aa  639    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0318  acetate/CoA ligase  54.36 
 
 
665 aa  633  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3974  acetyl-CoA synthetase  52.61 
 
 
647 aa  634  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162382  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  51.77 
 
 
645 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53.23 
 
 
644 aa  628  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>