More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0318 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  54.68 
 
 
660 aa  695    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  52.63 
 
 
644 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 
652 aa  643    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  72.12 
 
 
654 aa  917    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  52.48 
 
 
644 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  55.07 
 
 
660 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  54.17 
 
 
660 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  55.07 
 
 
660 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 
657 aa  636    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  52.41 
 
 
651 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  52.41 
 
 
651 aa  645    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.92 
 
 
656 aa  725    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  55.07 
 
 
660 aa  695    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  53.86 
 
 
651 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  54.55 
 
 
654 aa  700    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  68.4 
 
 
656 aa  909    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53.44 
 
 
658 aa  728    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  53.33 
 
 
660 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  56.79 
 
 
655 aa  733    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  54.31 
 
 
666 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.44 
 
 
657 aa  722    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  55.07 
 
 
660 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  55.54 
 
 
657 aa  726    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  54.16 
 
 
657 aa  696    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  51.92 
 
 
650 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  54.77 
 
 
660 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  53.2 
 
 
667 aa  693    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.21 
 
 
673 aa  736    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  53.36 
 
 
666 aa  709    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55 
 
 
657 aa  709    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  51.9 
 
 
664 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.71 
 
 
661 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  55.59 
 
 
653 aa  731    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  53.48 
 
 
664 aa  670    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.82 
 
 
660 aa  727    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.82 
 
 
656 aa  737    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  51.92 
 
 
650 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  54.92 
 
 
660 aa  695    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  56.58 
 
 
633 aa  699    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  55.86 
 
 
667 aa  687    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  55.07 
 
 
660 aa  695    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  55.07 
 
 
660 aa  695    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.16 
 
 
645 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  54.09 
 
 
660 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  51.89 
 
 
665 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  55.07 
 
 
660 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  51.92 
 
 
650 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  54.66 
 
 
654 aa  725    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  52.46 
 
 
665 aa  678    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  55.77 
 
 
658 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  54.74 
 
 
660 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  53.71 
 
 
645 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  53.49 
 
 
649 aa  706    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  66.98 
 
 
653 aa  858    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  52.47 
 
 
649 aa  643    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  68.97 
 
 
715 aa  917    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  65.49 
 
 
651 aa  836    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  54.68 
 
 
660 aa  695    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  57.78 
 
 
652 aa  725    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  55.45 
 
 
655 aa  716    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  50.65 
 
 
638 aa  647    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  53.83 
 
 
664 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  54.23 
 
 
660 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  66 
 
 
660 aa  864    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.11 
 
 
644 aa  706    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  52.25 
 
 
654 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  55.54 
 
 
655 aa  728    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  48.84 
 
 
652 aa  641    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  69.57 
 
 
661 aa  917    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  54.22 
 
 
658 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 
650 aa  638    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.6 
 
 
660 aa  730    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  54.92 
 
 
660 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  54.07 
 
 
664 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.98 
 
 
660 aa  726    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  53.87 
 
 
645 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  56.17 
 
 
670 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  68.59 
 
 
673 aa  862    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  69.38 
 
 
676 aa  899    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  54.23 
 
 
660 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  53.83 
 
 
664 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  49.84 
 
 
657 aa  637    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.73 
 
 
670 aa  665    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  49.4 
 
 
660 aa  647    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  52.97 
 
 
658 aa  724    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  66 
 
 
666 aa  864    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  53.83 
 
 
660 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  58.05 
 
 
656 aa  740    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  57.44 
 
 
673 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  68.36 
 
 
657 aa  885    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  53.78 
 
 
667 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  53.26 
 
 
665 aa  667    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  53.17 
 
 
664 aa  683    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  52.24 
 
 
638 aa  637    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  70.69 
 
 
664 aa  888    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  52.72 
 
 
650 aa  638    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  52.68 
 
 
667 aa  647    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  66 
 
 
660 aa  864    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  55.09 
 
 
658 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  66.26 
 
 
663 aa  855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>