More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1196 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  54.15 
 
 
653 aa  662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  53.54 
 
 
670 aa  651    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  52.33 
 
 
652 aa  650    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  54.7 
 
 
650 aa  707    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  50.38 
 
 
660 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  53.73 
 
 
655 aa  693    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  51.72 
 
 
626 aa  637    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  51.07 
 
 
666 aa  650    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  53.72 
 
 
629 aa  642    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  53.28 
 
 
639 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  53.11 
 
 
639 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  52.31 
 
 
664 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  51.15 
 
 
648 aa  678    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  51.94 
 
 
638 aa  656    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  51.14 
 
 
656 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  49.92 
 
 
658 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  49.3 
 
 
649 aa  643    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  49.09 
 
 
655 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  53.45 
 
 
657 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  54.56 
 
 
660 aa  731    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  51.96 
 
 
631 aa  675    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  51 
 
 
661 aa  654    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  49.3 
 
 
667 aa  642    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  49.92 
 
 
673 aa  655    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  49.3 
 
 
666 aa  649    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  49.17 
 
 
657 aa  646    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  50.38 
 
 
659 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  50.69 
 
 
661 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  50.08 
 
 
655 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  51.18 
 
 
632 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  50.92 
 
 
660 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  52.68 
 
 
656 aa  699    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  50.3 
 
 
661 aa  661    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  51.52 
 
 
651 aa  671    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 
715 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  51.65 
 
 
631 aa  672    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  50.86 
 
 
652 aa  666    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  53.79 
 
 
629 aa  639    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  48.76 
 
 
655 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  55.39 
 
 
631 aa  647    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.62 
 
 
664 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  55.14 
 
 
659 aa  662    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  48.47 
 
 
657 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  50 
 
 
649 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  49.54 
 
 
649 aa  671    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 
657 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  51.18 
 
 
632 aa  666    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  52.6 
 
 
643 aa  692    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  52.57 
 
 
652 aa  684    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  50.54 
 
 
658 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  48.4 
 
 
657 aa  649    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
663 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  54.26 
 
 
661 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  50.45 
 
 
644 aa  656    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  50.76 
 
 
660 aa  676    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  55.26 
 
 
653 aa  732    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.86 
 
 
655 aa  720    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  52.67 
 
 
664 aa  646    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  51.66 
 
 
652 aa  648    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  48.3 
 
 
664 aa  644    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  50.15 
 
 
658 aa  673    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  48.51 
 
 
667 aa  640    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  48.76 
 
 
655 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  49.85 
 
 
680 aa  657    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  52.58 
 
 
660 aa  689    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  54.05 
 
 
666 aa  685    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  53.54 
 
 
649 aa  692    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  51.69 
 
 
656 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  49.24 
 
 
667 aa  656    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  72.15 
 
 
659 aa  1001    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  74.58 
 
 
670 aa  1039    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  100 
 
 
660 aa  1357    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  64.82 
 
 
656 aa  917    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  53.38 
 
 
668 aa  657    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  52.72 
 
 
656 aa  669    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.07 
 
 
656 aa  699    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  54.86 
 
 
650 aa  721    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  50.98 
 
 
657 aa  671    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  48.83 
 
 
667 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  53.55 
 
 
638 aa  672    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  50.38 
 
 
658 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 
667 aa  690    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  52.16 
 
 
652 aa  654    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  51.49 
 
 
663 aa  653    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  53.95 
 
 
644 aa  679    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  51.61 
 
 
674 aa  651    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  48.64 
 
 
661 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  53.31 
 
 
656 aa  703    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  49.77 
 
 
658 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  51.06 
 
 
660 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  51.66 
 
 
666 aa  632  1e-180  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  52.11 
 
 
632 aa  632  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  51.84 
 
 
629 aa  632  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  54.64 
 
 
629 aa  633  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  49.46 
 
 
655 aa  634  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  49.6 
 
 
654 aa  630  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0067  acetate/CoA ligase  53.47 
 
 
651 aa  630  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118091  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  48.55 
 
 
650 aa  630  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  51.23 
 
 
661 aa  631  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4507  acetate/CoA ligase  50.54 
 
 
663 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>