More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2004 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  53.11 
 
 		 655 aa  679    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  53.41 
 
 		 655 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  49.61 
 
 		 666 aa  658    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  50.94 
 
 		 649 aa  659    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  60.95 
 
 		 644 aa  801    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  52.34 
 
 		 649 aa  669    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  50.48 
 
 		 666 aa  652    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  95.15 
 
 		 639 aa  1262    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  53.25 
 
 		 660 aa  691    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  49.69 
 
 		 661 aa  656    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  59.52 
 
 		 631 aa  815    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  53.8 
 
 		 631 aa  675    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  57.83 
 
 		 648 aa  727    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  50.89 
 
 		 654 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  51.32 
 
 		 658 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  50.79 
 
 		 645 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  52.91 
 
 		 635 aa  654    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  53.44 
 
 		 657 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  51.18 
 
 		 657 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  50.39 
 
 		 664 aa  684    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  52.67 
 
 		 632 aa  665    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  51.3 
 
 		 667 aa  671    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  50 
 
 		 673 aa  647    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  50.55 
 
 		 666 aa  687    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  50.69 
 
 		 657 aa  641    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  50.31 
 
 		 650 aa  635    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.23 
 
 		 661 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  53.38 
 
 		 649 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.25 
 
 		 656 aa  680    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  53.01 
 
 		 664 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  59.19 
 
 		 631 aa  813    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 		 652 aa  652    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  52.22 
 
 		 629 aa  653    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  56.62 
 
 		 651 aa  704    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  50.49 
 
 		 629 aa  649    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  52.19 
 
 		 656 aa  685    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  51.95 
 
 		 670 aa  652    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  51.29 
 
 		 655 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  53.21 
 
 		 629 aa  641    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  51.92 
 
 		 656 aa  665    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  52.5 
 
 		 632 aa  649    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  53.33 
 
 		 660 aa  680    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  49.22 
 
 		 657 aa  652    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  53.59 
 
 		 652 aa  708    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  52.1 
 
 		 636 aa  635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.53 
 
 		 655 aa  671    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  58.41 
 
 		 632 aa  817    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  52.06 
 
 		 629 aa  652    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 		 657 aa  684    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  54.31 
 
 		 643 aa  664    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  54.59 
 
 		 644 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  52.24 
 
 		 666 aa  687    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  51.09 
 
 		 655 aa  661    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.1 
 
 		 664 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  61.83 
 
 		 650 aa  824    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  51.85 
 
 		 663 aa  671    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  51.63 
 
 		 667 aa  678    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  51.6 
 
 		 668 aa  655    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  50.79 
 
 		 645 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  61.34 
 
 		 653 aa  828    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  54.08 
 
 		 657 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  51.16 
 
 		 658 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  51.32 
 
 		 658 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.5 
 
 		 670 aa  650    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  53.11 
 
 		 660 aa  649    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  54.5 
 
 		 631 aa  665    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  50.74 
 
 		 656 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  50.7 
 
 		 658 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.71 
 
 		 667 aa  684    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  100 
 
 		 639 aa  1319    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  47.43 
 
 		 660 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  54.84 
 
 		 638 aa  716    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  53.69 
 
 		 667 aa  701    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  58.25 
 
 		 632 aa  815    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  53.11 
 
 		 655 aa  679    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  61.99 
 
 		 650 aa  819    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52 
 
 		 661 aa  646    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  51.22 
 
 		 667 aa  640    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  49.6 
 
 		 663 aa  633  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  50.16 
 
 		 632 aa  634  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  47.26 
 
 		 664 aa  632  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  49.52 
 
 		 644 aa  633  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  51.06 
 
 		 647 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  51.53 
 
 		 654 aa  630  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.2 
 
 		 662 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  47.43 
 
 		 660 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 		 645 aa  626  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  49.17 
 
 		 638 aa  624  1e-177  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  51.58 
 
 		 655 aa  623  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  49.68 
 
 		 645 aa  622  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  50.64 
 
 		 651 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  50.4 
 
 		 658 aa  622  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  52.34 
 
 		 661 aa  624  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  49.76 
 
 		 645 aa  624  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  52.44 
 
 		 659 aa  624  1e-177  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  48.31 
 
 		 649 aa  620  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  48.73 
 
 		 651 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  47.46 
 
 		 648 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  49.84 
 
 		 657 aa  619  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  47.05 
 
 		 660 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>